Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MKI67P46013 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
MKI67P46013 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
MKI67P46013 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
MKI67P46013 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MKI67P46013 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MKI67P46013 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MKI67P46013 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
MKI67P46013 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
MKI67P46013 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
MKI67P46013 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MKI67P46013 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
MKI67P46013 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MKI67P46013 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
MKI67P46013 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MKI67P46013 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MKI67P46013 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
MKI67P46013 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
MKI67P46013 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
MKI67P46013 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MKI67P46013 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MKI67P46013 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MKI67P46013 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MKI67P46013 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MKI67P46013 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MKI67P46013 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MKI67P46013 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
MKI67P46013 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MKI67P46013 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MKI67P46013 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MKI67P46013 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MKI67P46013 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MKI67P46013 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MKI67P46013 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MKI67P46013 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
MKI67P46013 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MKI67P46013 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MKI67P46013 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MKI67P46013 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MKI67P46013 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MKI67P46013 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MKI67P46013 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MKI67P46013 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MKI67P46013 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MKI67P46013 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MKI67P46013 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MKI67P46013 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MKI67P46013 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MKI67P46013 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
MKI67P46013 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MKI67P46013 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
MKI67P46013 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
MKI67P46013 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
MKI67P46013 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
MKI67P46013 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
MKI67P46013 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
MKI67P46013 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
MKI67P46013 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
MKI67P46013 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
MKI67P46013 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
MKI67P46013 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MKI67P46013 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
MKI67P46013 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MKI67P46013 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
MKI67P46013 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MKI67P46013 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MKI67P46013 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MKI67P46013 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MKI67P46013 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MKI67P46013 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
MKI67P46013 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
MKI67P46013 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MKI67P46013 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MKI67P46013 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MKI67P46013 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MKI67P46013 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MKI67P46013 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MKI67P46013 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
MKI67P46013 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MKI67P46013 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MKI67P46013 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MKI67P46013 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MKI67P46013 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MKI67P46013 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MKI67P46013 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MKI67P46013 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
MKI67P46013 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
MKI67P46013 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
MKI67P46013 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
MKI67P46013 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
MKI67P46013 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
MKI67P46013 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
MKI67P46013 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
MKI67P46013 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
MKI67P46013 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MKI67P46013 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MKI67P46013 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MKI67P46013 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MKI67P46013 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MKI67P46013 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms