Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX2-1P43699 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX2-1P43699 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX2-1P43699 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX2-1P43699 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX2-1P43699 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX2-1P43699 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX2-1P43699 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKX2-1P43699 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKX2-1P43699 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKX2-1P43699 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX2-1P43699 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX2-1P43699 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX2-1P43699 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX2-1P43699 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX2-1P43699 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX2-1P43699 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX2-1P43699 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX2-1P43699 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX2-1P43699 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NKX2-1P43699 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKX2-1P43699 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKX2-1P43699 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX2-1P43699 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX2-1P43699 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKX2-1P43699 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKX2-1P43699 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKX2-1P43699 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKX2-1P43699 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKX2-1P43699 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKX2-1P43699 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKX2-1P43699 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKX2-1P43699 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKX2-1P43699 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKX2-1P43699 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKX2-1P43699 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKX2-1P43699 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKX2-1P43699 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX2-1P43699 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX2-1P43699 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NKX2-1P43699 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKX2-1P43699 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKX2-1P43699 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKX2-1P43699 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKX2-1P43699 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKX2-1P43699 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKX2-1P43699 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKX2-1P43699 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NKX2-1P43699 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKX2-1P43699 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKX2-1P43699 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKX2-1P43699 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKX2-1P43699 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKX2-1P43699 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKX2-1P43699 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKX2-1P43699 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKX2-1P43699 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKX2-1P43699 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKX2-1P43699 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NKX2-1P43699 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX2-1P43699 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX2-1P43699 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX2-1P43699 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX2-1P43699 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKX2-1P43699 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKX2-1P43699 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKX2-1P43699 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKX2-1P43699 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKX2-1P43699 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKX2-1P43699 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKX2-1P43699 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKX2-1P43699 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKX2-1P43699 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKX2-1P43699 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKX2-1P43699 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKX2-1P43699 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKX2-1P43699 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKX2-1P43699 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKX2-1P43699 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKX2-1P43699 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKX2-1P43699 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKX2-1P43699 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKX2-1P43699 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX2-1P43699 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX2-1P43699 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX2-1P43699 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX2-1P43699 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX2-1P43699 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX2-1P43699 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX2-1P43699 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX2-1P43699 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX2-1P43699 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX2-1P43699 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX2-1P43699 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX2-1P43699 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKX2-1P43699 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX2-1P43699 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX2-1P43699 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX2-1P43699 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX2-1P43699 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms