Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATA4P43694 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATA4P43694 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATA4P43694 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATA4P43694 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATA4P43694 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATA4P43694 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA4P43694 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA4P43694 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA4P43694 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA4P43694 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA4P43694 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATA4P43694 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATA4P43694 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATA4P43694 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATA4P43694 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATA4P43694 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GATA4P43694 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATA4P43694 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATA4P43694 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATA4P43694 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATA4P43694 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GATA4P43694 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATA4P43694 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATA4P43694 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATA4P43694 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATA4P43694 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATA4P43694 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATA4P43694 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATA4P43694 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATA4P43694 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GATA4P43694 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GATA4P43694 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GATA4P43694 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GATA4P43694 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATA4P43694 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATA4P43694 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATA4P43694 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATA4P43694 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATA4P43694 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GATA4P43694 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATA4P43694 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATA4P43694 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATA4P43694 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATA4P43694 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GATA4P43694 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATA4P43694 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATA4P43694 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATA4P43694 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATA4P43694 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATA4P43694 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATA4P43694 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATA4P43694 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATA4P43694 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATA4P43694 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATA4P43694 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GATA4P43694 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GATA4P43694 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATA4P43694 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATA4P43694 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATA4P43694 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATA4P43694 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATA4P43694 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATA4P43694 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATA4P43694 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATA4P43694 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GATA4P43694 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA4P43694 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA4P43694 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA4P43694 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA4P43694 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA4P43694 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA4P43694 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA4P43694 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GATA4P43694 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATA4P43694 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA4P43694 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA4P43694 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA4P43694 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA4P43694 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA4P43694 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA4P43694 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA4P43694 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA4P43694 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATA4P43694 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GATA4P43694 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATA4P43694 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATA4P43694 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATA4P43694 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATA4P43694 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATA4P43694 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATA4P43694 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GATA4P43694 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA4P43694 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA4P43694 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA4P43694 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GATA4P43694 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATA4P43694 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATA4P43694 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATA4P43694 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms