Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A3P43003 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A3P43003 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A3P43003 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A3P43003 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A3P43003 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A3P43003 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A3P43003 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A3P43003 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A3P43003 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A3P43003 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A3P43003 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A3P43003 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A3P43003 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A3P43003 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A3P43003 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A3P43003 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A3P43003 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A3P43003 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A3P43003 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A3P43003 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A3P43003 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A3P43003 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A3P43003 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A3P43003 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A3P43003 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A3P43003 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A3P43003 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A3P43003 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A3P43003 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A3P43003 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A3P43003 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A3P43003 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A3P43003 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A3P43003 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A3P43003 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A3P43003 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A3P43003 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A3P43003 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A3P43003 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A3P43003 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A3P43003 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A3P43003 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A3P43003 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A3P43003 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A3P43003 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A3P43003 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A3P43003 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A3P43003 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A3P43003 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A3P43003 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A3P43003 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A3P43003 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A3P43003 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A3P43003 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A3P43003 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A3P43003 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A3P43003 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A3P43003 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A3P43003 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A3P43003 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A3P43003 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A3P43003 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A3P43003 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A3P43003 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC1A3P43003 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A3P43003 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A3P43003 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A3P43003 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A3P43003 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A3P43003 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A3P43003 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A3P43003 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A3P43003 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A3P43003 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A3P43003 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A3P43003 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A3P43003 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A3P43003 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A3P43003 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A3P43003 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC1A3P43003 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A3P43003 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A3P43003 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A3P43003 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A3P43003 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A3P43003 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A3P43003 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A3P43003 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A3P43003 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A3P43003 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A3P43003 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A3P43003 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A3P43003 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A3P43003 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A3P43003 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A3P43003 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC1A3P43003 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC1A3P43003 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A3P43003 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms