Protein–RNA interactions for Protein: P36980

CFHR2, Complement factor H-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR2P36980 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFHR2P36980 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFHR2P36980 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFHR2P36980 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFHR2P36980 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFHR2P36980 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFHR2P36980 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFHR2P36980 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFHR2P36980 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFHR2P36980 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFHR2P36980 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFHR2P36980 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFHR2P36980 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CFHR2P36980 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFHR2P36980 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFHR2P36980 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFHR2P36980 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFHR2P36980 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFHR2P36980 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFHR2P36980 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFHR2P36980 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFHR2P36980 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFHR2P36980 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFHR2P36980 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFHR2P36980 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFHR2P36980 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFHR2P36980 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFHR2P36980 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFHR2P36980 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFHR2P36980 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFHR2P36980 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CFHR2P36980 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CFHR2P36980 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFHR2P36980 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFHR2P36980 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFHR2P36980 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFHR2P36980 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFHR2P36980 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CFHR2P36980 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFHR2P36980 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFHR2P36980 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHR2P36980 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHR2P36980 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHR2P36980 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFHR2P36980 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFHR2P36980 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFHR2P36980 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHR2P36980 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHR2P36980 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHR2P36980 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHR2P36980 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHR2P36980 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFHR2P36980 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFHR2P36980 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFHR2P36980 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFHR2P36980 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CFHR2P36980 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFHR2P36980 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFHR2P36980 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFHR2P36980 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CFHR2P36980 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFHR2P36980 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CFHR2P36980 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFHR2P36980 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFHR2P36980 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFHR2P36980 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHR2P36980 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHR2P36980 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHR2P36980 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHR2P36980 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFHR2P36980 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFHR2P36980 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms