Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MYH11P35749 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MYH11P35749 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MYH11P35749 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MYH11P35749 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
MYH11P35749 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MYH11P35749 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MYH11P35749 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MYH11P35749 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MYH11P35749 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MYH11P35749 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
MYH11P35749 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MYH11P35749 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MYH11P35749 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MYH11P35749 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MYH11P35749 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MYH11P35749 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MYH11P35749 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
MYH11P35749 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
MYH11P35749 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
MYH11P35749 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MYH11P35749 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
MYH11P35749 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MYH11P35749 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MYH11P35749 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MYH11P35749 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MYH11P35749 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MYH11P35749 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MYH11P35749 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MYH11P35749 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MYH11P35749 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MYH11P35749 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MYH11P35749 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MYH11P35749 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MYH11P35749 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MYH11P35749 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MYH11P35749 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MYH11P35749 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MYH11P35749 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MYH11P35749 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYH11P35749 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYH11P35749 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYH11P35749 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MYH11P35749 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MYH11P35749 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYH11P35749 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MYH11P35749 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MYH11P35749 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYH11P35749 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYH11P35749 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MYH11P35749 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MYH11P35749 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
MYH11P35749 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MYH11P35749 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MYH11P35749 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MYH11P35749 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYH11P35749 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYH11P35749 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYH11P35749 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYH11P35749 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYH11P35749 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
MYH11P35749 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MYH11P35749 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MYH11P35749 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
MYH11P35749 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYH11P35749 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYH11P35749 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYH11P35749 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MYH11P35749 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MYH11P35749 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MYH11P35749 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MYH11P35749 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
MYH11P35749 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MYH11P35749 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MYH11P35749 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MYH11P35749 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MYH11P35749 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MYH11P35749 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
MYH11P35749 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
MYH11P35749 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MYH11P35749 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MYH11P35749 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MYH11P35749 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MYH11P35749 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MYH11P35749 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MYH11P35749 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MYH11P35749 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MYH11P35749 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MYH11P35749 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MYH11P35749 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYH11P35749 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYH11P35749 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MYH11P35749 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MYH11P35749 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MYH11P35749 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MYH11P35749 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
MYH11P35749 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYH11P35749 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYH11P35749 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYH11P35749 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.1 ms