Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HLA-FP30511 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HLA-FP30511 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HLA-FP30511 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HLA-FP30511 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HLA-FP30511 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HLA-FP30511 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HLA-FP30511 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HLA-FP30511 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HLA-FP30511 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HLA-FP30511 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HLA-FP30511 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HLA-FP30511 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HLA-FP30511 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HLA-FP30511 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HLA-FP30511 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HLA-FP30511 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HLA-FP30511 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HLA-FP30511 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HLA-FP30511 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HLA-FP30511 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HLA-FP30511 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HLA-FP30511 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HLA-FP30511 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HLA-FP30511 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HLA-FP30511 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HLA-FP30511 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HLA-FP30511 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HLA-FP30511 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HLA-FP30511 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HLA-FP30511 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HLA-FP30511 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HLA-FP30511 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HLA-FP30511 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HLA-FP30511 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HLA-FP30511 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HLA-FP30511 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HLA-FP30511 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HLA-FP30511 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HLA-FP30511 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HLA-FP30511 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HLA-FP30511 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HLA-FP30511 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HLA-FP30511 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HLA-FP30511 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HLA-FP30511 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HLA-FP30511 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HLA-FP30511 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HLA-FP30511 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HLA-FP30511 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HLA-FP30511 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HLA-FP30511 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HLA-FP30511 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HLA-FP30511 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HLA-FP30511 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HLA-FP30511 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HLA-FP30511 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HLA-FP30511 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HLA-FP30511 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HLA-FP30511 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HLA-FP30511 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HLA-FP30511 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HLA-FP30511 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HLA-FP30511 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HLA-FP30511 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HLA-FP30511 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HLA-FP30511 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HLA-FP30511 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HLA-FP30511 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HLA-FP30511 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HLA-FP30511 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HLA-FP30511 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms