Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SERPINB3P29508 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SERPINB3P29508 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SERPINB3P29508 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SERPINB3P29508 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SERPINB3P29508 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SERPINB3P29508 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SERPINB3P29508 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SERPINB3P29508 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SERPINB3P29508 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SERPINB3P29508 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SERPINB3P29508 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SERPINB3P29508 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SERPINB3P29508 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SERPINB3P29508 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SERPINB3P29508 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SERPINB3P29508 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SERPINB3P29508 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SERPINB3P29508 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SERPINB3P29508 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SERPINB3P29508 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SERPINB3P29508 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SERPINB3P29508 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SERPINB3P29508 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SERPINB3P29508 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SERPINB3P29508 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SERPINB3P29508 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SERPINB3P29508 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SERPINB3P29508 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SERPINB3P29508 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SERPINB3P29508 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SERPINB3P29508 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SERPINB3P29508 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SERPINB3P29508 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SERPINB3P29508 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SERPINB3P29508 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SERPINB3P29508 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SERPINB3P29508 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SERPINB3P29508 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SERPINB3P29508 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SERPINB3P29508 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SERPINB3P29508 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SERPINB3P29508 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SERPINB3P29508 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SERPINB3P29508 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SERPINB3P29508 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SERPINB3P29508 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SERPINB3P29508 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SERPINB3P29508 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SERPINB3P29508 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SERPINB3P29508 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SERPINB3P29508 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SERPINB3P29508 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SERPINB3P29508 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SERPINB3P29508 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SERPINB3P29508 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SERPINB3P29508 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SERPINB3P29508 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SERPINB3P29508 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SERPINB3P29508 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SERPINB3P29508 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SERPINB3P29508 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SERPINB3P29508 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SERPINB3P29508 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SERPINB3P29508 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SERPINB3P29508 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SERPINB3P29508 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SERPINB3P29508 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SERPINB3P29508 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SERPINB3P29508 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SERPINB3P29508 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SERPINB3P29508 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SERPINB3P29508 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SERPINB3P29508 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SERPINB3P29508 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SERPINB3P29508 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SERPINB3P29508 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SERPINB3P29508 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SERPINB3P29508 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SERPINB3P29508 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SERPINB3P29508 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SERPINB3P29508 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SERPINB3P29508 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SERPINB3P29508 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SERPINB3P29508 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SERPINB3P29508 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SERPINB3P29508 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SERPINB3P29508 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SERPINB3P29508 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SERPINB3P29508 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SERPINB3P29508 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SERPINB3P29508 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SERPINB3P29508 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SERPINB3P29508 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SERPINB3P29508 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SERPINB3P29508 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SERPINB3P29508 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SERPINB3P29508 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SERPINB3P29508 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SERPINB3P29508 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms