Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GABRB3P28472 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GABRB3P28472 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GABRB3P28472 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GABRB3P28472 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GABRB3P28472 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GABRB3P28472 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GABRB3P28472 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GABRB3P28472 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GABRB3P28472 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABRB3P28472 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABRB3P28472 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABRB3P28472 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABRB3P28472 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABRB3P28472 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABRB3P28472 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABRB3P28472 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABRB3P28472 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABRB3P28472 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABRB3P28472 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GABRB3P28472 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GABRB3P28472 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GABRB3P28472 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GABRB3P28472 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GABRB3P28472 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GABRB3P28472 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GABRB3P28472 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABRB3P28472 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABRB3P28472 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABRB3P28472 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GABRB3P28472 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GABRB3P28472 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GABRB3P28472 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GABRB3P28472 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GABRB3P28472 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABRB3P28472 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABRB3P28472 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABRB3P28472 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABRB3P28472 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABRB3P28472 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABRB3P28472 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABRB3P28472 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABRB3P28472 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABRB3P28472 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABRB3P28472 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABRB3P28472 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABRB3P28472 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GABRB3P28472 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GABRB3P28472 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABRB3P28472 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABRB3P28472 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABRB3P28472 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABRB3P28472 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABRB3P28472 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABRB3P28472 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABRB3P28472 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABRB3P28472 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABRB3P28472 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABRB3P28472 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GABRB3P28472 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GABRB3P28472 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GABRB3P28472 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GABRB3P28472 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GABRB3P28472 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GABRB3P28472 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GABRB3P28472 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GABRB3P28472 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GABRB3P28472 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GABRB3P28472 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GABRB3P28472 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GABRB3P28472 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GABRB3P28472 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GABRB3P28472 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GABRB3P28472 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GABRB3P28472 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GABRB3P28472 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GABRB3P28472 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GABRB3P28472 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GABRB3P28472 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GABRB3P28472 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GABRB3P28472 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GABRB3P28472 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GABRB3P28472 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GABRB3P28472 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GABRB3P28472 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GABRB3P28472 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GABRB3P28472 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GABRB3P28472 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GABRB3P28472 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABRB3P28472 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABRB3P28472 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABRB3P28472 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABRB3P28472 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABRB3P28472 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABRB3P28472 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GABRB3P28472 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GABRB3P28472 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABRB3P28472 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABRB3P28472 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GABRB3P28472 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms