Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMB4P28070 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMB4P28070 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMB4P28070 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMB4P28070 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMB4P28070 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMB4P28070 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMB4P28070 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PSMB4P28070 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PSMB4P28070 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PSMB4P28070 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMB4P28070 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMB4P28070 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMB4P28070 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMB4P28070 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMB4P28070 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMB4P28070 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMB4P28070 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMB4P28070 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMB4P28070 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMB4P28070 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMB4P28070 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMB4P28070 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMB4P28070 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMB4P28070 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMB4P28070 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMB4P28070 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMB4P28070 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMB4P28070 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMB4P28070 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMB4P28070 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMB4P28070 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMB4P28070 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMB4P28070 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMB4P28070 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMB4P28070 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMB4P28070 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMB4P28070 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMB4P28070 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMB4P28070 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMB4P28070 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMB4P28070 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMB4P28070 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMB4P28070 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMB4P28070 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMB4P28070 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMB4P28070 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMB4P28070 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMB4P28070 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMB4P28070 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMB4P28070 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMB4P28070 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PSMB4P28070 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PSMB4P28070 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMB4P28070 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMB4P28070 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMB4P28070 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMB4P28070 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMB4P28070 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMB4P28070 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMB4P28070 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMB4P28070 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMB4P28070 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMB4P28070 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PSMB4P28070 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSMB4P28070 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSMB4P28070 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSMB4P28070 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMB4P28070 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMB4P28070 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMB4P28070 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMB4P28070 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMB4P28070 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMB4P28070 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMB4P28070 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMB4P28070 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMB4P28070 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMB4P28070 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMB4P28070 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMB4P28070 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMB4P28070 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMB4P28070 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PSMB4P28070 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PSMB4P28070 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PSMB4P28070 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMB4P28070 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMB4P28070 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMB4P28070 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMB4P28070 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMB4P28070 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMB4P28070 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMB4P28070 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMB4P28070 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMB4P28070 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMB4P28070 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMB4P28070 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMB4P28070 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMB4P28070 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMB4P28070 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMB4P28070 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms