Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PDE4AP27815 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PDE4AP27815 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PDE4AP27815 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PDE4AP27815 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PDE4AP27815 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PDE4AP27815 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PDE4AP27815 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PDE4AP27815 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PDE4AP27815 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PDE4AP27815 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PDE4AP27815 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PDE4AP27815 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PDE4AP27815 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PDE4AP27815 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PDE4AP27815 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PDE4AP27815 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PDE4AP27815 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PDE4AP27815 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PDE4AP27815 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PDE4AP27815 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PDE4AP27815 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PDE4AP27815 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PDE4AP27815 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PDE4AP27815 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PDE4AP27815 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PDE4AP27815 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PDE4AP27815 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PDE4AP27815 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PDE4AP27815 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PDE4AP27815 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PDE4AP27815 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PDE4AP27815 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PDE4AP27815 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PDE4AP27815 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PDE4AP27815 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PDE4AP27815 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PDE4AP27815 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PDE4AP27815 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PDE4AP27815 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PDE4AP27815 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PDE4AP27815 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PDE4AP27815 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PDE4AP27815 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PDE4AP27815 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PDE4AP27815 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PDE4AP27815 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PDE4AP27815 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PDE4AP27815 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PDE4AP27815 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PDE4AP27815 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PDE4AP27815 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PDE4AP27815 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PDE4AP27815 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PDE4AP27815 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PDE4AP27815 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PDE4AP27815 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PDE4AP27815 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.9
PDE4AP27815 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PDE4AP27815 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PDE4AP27815 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PDE4AP27815 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PDE4AP27815 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
PDE4AP27815 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PDE4AP27815 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PDE4AP27815 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PDE4AP27815 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PDE4AP27815 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PDE4AP27815 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PDE4AP27815 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PDE4AP27815 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PDE4AP27815 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PDE4AP27815 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PDE4AP27815 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PDE4AP27815 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PDE4AP27815 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PDE4AP27815 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PDE4AP27815 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PDE4AP27815 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PDE4AP27815 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PDE4AP27815 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PDE4AP27815 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PDE4AP27815 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PDE4AP27815 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PDE4AP27815 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PDE4AP27815 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PDE4AP27815 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
PDE4AP27815 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PDE4AP27815 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PDE4AP27815 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PDE4AP27815 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PDE4AP27815 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PDE4AP27815 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PDE4AP27815 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PDE4AP27815 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PDE4AP27815 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PDE4AP27815 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PDE4AP27815 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PDE4AP27815 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PDE4AP27815 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms