Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLNP26678 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLNP26678 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLNP26678 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLNP26678 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLNP26678 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLNP26678 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLNP26678 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLNP26678 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLNP26678 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLNP26678 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLNP26678 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLNP26678 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLNP26678 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLNP26678 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLNP26678 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLNP26678 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLNP26678 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLNP26678 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLNP26678 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLNP26678 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLNP26678 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLNP26678 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLNP26678 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLNP26678 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLNP26678 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PLNP26678 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLNP26678 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLNP26678 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLNP26678 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLNP26678 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLNP26678 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLNP26678 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLNP26678 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PLNP26678 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLNP26678 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLNP26678 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLNP26678 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLNP26678 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLNP26678 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLNP26678 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLNP26678 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLNP26678 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLNP26678 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLNP26678 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLNP26678 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLNP26678 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLNP26678 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLNP26678 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLNP26678 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLNP26678 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLNP26678 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLNP26678 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLNP26678 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLNP26678 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PLNP26678 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLNP26678 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLNP26678 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLNP26678 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLNP26678 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLNP26678 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLNP26678 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLNP26678 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLNP26678 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLNP26678 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLNP26678 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLNP26678 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLNP26678 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLNP26678 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLNP26678 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLNP26678 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLNP26678 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLNP26678 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLNP26678 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLNP26678 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLNP26678 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLNP26678 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLNP26678 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLNP26678 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLNP26678 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLNP26678 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLNP26678 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLNP26678 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLNP26678 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLNP26678 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLNP26678 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLNP26678 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLNP26678 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLNP26678 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLNP26678 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLNP26678 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLNP26678 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PLNP26678 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PLNP26678 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PLNP26678 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PLNP26678 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PLNP26678 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLNP26678 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLNP26678 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLNP26678 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms