Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMO1P25800 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LMO1P25800 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO1P25800 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO1P25800 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO1P25800 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO1P25800 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO1P25800 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO1P25800 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO1P25800 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO1P25800 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO1P25800 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO1P25800 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO1P25800 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO1P25800 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO1P25800 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO1P25800 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMO1P25800 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMO1P25800 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMO1P25800 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LMO1P25800 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMO1P25800 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMO1P25800 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMO1P25800 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO1P25800 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO1P25800 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO1P25800 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO1P25800 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO1P25800 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO1P25800 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO1P25800 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO1P25800 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO1P25800 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO1P25800 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO1P25800 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO1P25800 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO1P25800 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMO1P25800 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMO1P25800 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMO1P25800 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO1P25800 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO1P25800 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO1P25800 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO1P25800 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO1P25800 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO1P25800 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO1P25800 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LMO1P25800 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMO1P25800 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMO1P25800 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMO1P25800 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMO1P25800 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMO1P25800 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMO1P25800 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMO1P25800 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMO1P25800 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMO1P25800 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LMO1P25800 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMO1P25800 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMO1P25800 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LMO1P25800 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMO1P25800 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMO1P25800 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LMO1P25800 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LMO1P25800 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMO1P25800 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LMO1P25800 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMO1P25800 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMO1P25800 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMO1P25800 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMO1P25800 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO1P25800 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO1P25800 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO1P25800 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO1P25800 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO1P25800 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO1P25800 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO1P25800 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO1P25800 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO1P25800 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO1P25800 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO1P25800 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO1P25800 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO1P25800 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO1P25800 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO1P25800 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO1P25800 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO1P25800 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO1P25800 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO1P25800 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO1P25800 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO1P25800 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO1P25800 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO1P25800 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO1P25800 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO1P25800 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO1P25800 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO1P25800 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO1P25800 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO1P25800 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms