Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMA1P25391 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMA1P25391 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMA1P25391 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMA1P25391 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMA1P25391 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMA1P25391 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LAMA1P25391 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMA1P25391 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMA1P25391 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMA1P25391 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA1P25391 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA1P25391 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA1P25391 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA1P25391 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMA1P25391 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMA1P25391 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMA1P25391 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMA1P25391 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMA1P25391 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMA1P25391 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMA1P25391 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMA1P25391 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMA1P25391 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMA1P25391 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMA1P25391 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMA1P25391 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMA1P25391 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMA1P25391 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMA1P25391 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMA1P25391 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMA1P25391 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMA1P25391 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMA1P25391 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMA1P25391 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMA1P25391 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMA1P25391 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMA1P25391 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LAMA1P25391 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMA1P25391 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMA1P25391 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMA1P25391 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMA1P25391 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMA1P25391 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMA1P25391 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMA1P25391 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMA1P25391 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMA1P25391 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMA1P25391 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMA1P25391 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMA1P25391 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMA1P25391 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMA1P25391 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMA1P25391 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMA1P25391 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMA1P25391 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMA1P25391 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMA1P25391 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMA1P25391 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMA1P25391 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMA1P25391 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMA1P25391 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMA1P25391 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMA1P25391 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMA1P25391 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMA1P25391 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMA1P25391 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMA1P25391 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMA1P25391 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMA1P25391 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMA1P25391 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMA1P25391 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMA1P25391 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMA1P25391 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMA1P25391 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMA1P25391 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMA1P25391 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMA1P25391 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMA1P25391 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMA1P25391 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMA1P25391 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMA1P25391 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMA1P25391 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMA1P25391 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMA1P25391 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMA1P25391 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMA1P25391 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMA1P25391 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMA1P25391 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMA1P25391 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMA1P25391 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMA1P25391 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMA1P25391 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMA1P25391 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMA1P25391 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMA1P25391 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMA1P25391 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMA1P25391 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMA1P25391 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMA1P25391 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms