Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLDCP23378 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLDCP23378 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLDCP23378 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GLDCP23378 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GLDCP23378 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLDCP23378 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLDCP23378 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLDCP23378 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GLDCP23378 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GLDCP23378 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GLDCP23378 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GLDCP23378 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GLDCP23378 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GLDCP23378 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GLDCP23378 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GLDCP23378 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GLDCP23378 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GLDCP23378 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLDCP23378 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLDCP23378 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLDCP23378 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLDCP23378 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLDCP23378 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLDCP23378 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLDCP23378 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLDCP23378 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLDCP23378 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
GLDCP23378 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLDCP23378 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLDCP23378 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GLDCP23378 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLDCP23378 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLDCP23378 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GLDCP23378 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GLDCP23378 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GLDCP23378 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GLDCP23378 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GLDCP23378 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GLDCP23378 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GLDCP23378 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GLDCP23378 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GLDCP23378 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GLDCP23378 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GLDCP23378 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GLDCP23378 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GLDCP23378 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GLDCP23378 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GLDCP23378 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GLDCP23378 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GLDCP23378 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GLDCP23378 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GLDCP23378 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GLDCP23378 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLDCP23378 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GLDCP23378 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GLDCP23378 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GLDCP23378 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GLDCP23378 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GLDCP23378 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GLDCP23378 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GLDCP23378 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GLDCP23378 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GLDCP23378 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GLDCP23378 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GLDCP23378 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GLDCP23378 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLDCP23378 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLDCP23378 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLDCP23378 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLDCP23378 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLDCP23378 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLDCP23378 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLDCP23378 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLDCP23378 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLDCP23378 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GLDCP23378 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GLDCP23378 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GLDCP23378 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GLDCP23378 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLDCP23378 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLDCP23378 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLDCP23378 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLDCP23378 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLDCP23378 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLDCP23378 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLDCP23378 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLDCP23378 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLDCP23378 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLDCP23378 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLDCP23378 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLDCP23378 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GLDCP23378 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLDCP23378 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLDCP23378 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLDCP23378 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLDCP23378 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLDCP23378 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLDCP23378 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLDCP23378 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms