Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCP2P22307 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SCP2P22307 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCP2P22307 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCP2P22307 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCP2P22307 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SCP2P22307 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCP2P22307 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCP2P22307 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCP2P22307 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCP2P22307 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCP2P22307 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCP2P22307 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCP2P22307 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCP2P22307 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCP2P22307 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCP2P22307 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCP2P22307 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCP2P22307 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCP2P22307 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCP2P22307 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCP2P22307 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCP2P22307 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCP2P22307 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCP2P22307 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCP2P22307 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCP2P22307 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCP2P22307 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCP2P22307 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCP2P22307 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCP2P22307 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCP2P22307 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCP2P22307 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCP2P22307 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCP2P22307 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCP2P22307 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCP2P22307 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCP2P22307 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCP2P22307 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCP2P22307 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SCP2P22307 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCP2P22307 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCP2P22307 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCP2P22307 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SCP2P22307 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCP2P22307 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCP2P22307 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCP2P22307 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCP2P22307 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCP2P22307 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCP2P22307 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCP2P22307 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCP2P22307 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCP2P22307 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCP2P22307 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCP2P22307 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCP2P22307 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCP2P22307 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCP2P22307 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCP2P22307 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCP2P22307 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCP2P22307 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCP2P22307 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCP2P22307 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCP2P22307 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCP2P22307 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCP2P22307 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCP2P22307 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SCP2P22307 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCP2P22307 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCP2P22307 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCP2P22307 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCP2P22307 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCP2P22307 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCP2P22307 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCP2P22307 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCP2P22307 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCP2P22307 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCP2P22307 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCP2P22307 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCP2P22307 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCP2P22307 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SCP2P22307 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCP2P22307 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCP2P22307 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCP2P22307 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCP2P22307 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SCP2P22307 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCP2P22307 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SCP2P22307 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCP2P22307 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCP2P22307 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCP2P22307 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCP2P22307 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCP2P22307 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SCP2P22307 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SCP2P22307 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SCP2P22307 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCP2P22307 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCP2P22307 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms