Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCP2P22307 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SCP2P22307 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCP2P22307 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCP2P22307 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCP2P22307 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SCP2P22307 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCP2P22307 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCP2P22307 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCP2P22307 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCP2P22307 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCP2P22307 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCP2P22307 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCP2P22307 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCP2P22307 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCP2P22307 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCP2P22307 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCP2P22307 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCP2P22307 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCP2P22307 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCP2P22307 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCP2P22307 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCP2P22307 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCP2P22307 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCP2P22307 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCP2P22307 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCP2P22307 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCP2P22307 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCP2P22307 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCP2P22307 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCP2P22307 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCP2P22307 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCP2P22307 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCP2P22307 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCP2P22307 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCP2P22307 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCP2P22307 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCP2P22307 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCP2P22307 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCP2P22307 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SCP2P22307 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCP2P22307 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCP2P22307 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCP2P22307 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SCP2P22307 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCP2P22307 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCP2P22307 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCP2P22307 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCP2P22307 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCP2P22307 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCP2P22307 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCP2P22307 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCP2P22307 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCP2P22307 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCP2P22307 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCP2P22307 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCP2P22307 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCP2P22307 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCP2P22307 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCP2P22307 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCP2P22307 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCP2P22307 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCP2P22307 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCP2P22307 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCP2P22307 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCP2P22307 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCP2P22307 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCP2P22307 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SCP2P22307 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCP2P22307 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCP2P22307 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCP2P22307 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCP2P22307 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCP2P22307 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCP2P22307 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCP2P22307 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCP2P22307 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCP2P22307 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCP2P22307 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCP2P22307 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCP2P22307 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCP2P22307 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SCP2P22307 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCP2P22307 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCP2P22307 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCP2P22307 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCP2P22307 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SCP2P22307 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCP2P22307 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SCP2P22307 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCP2P22307 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCP2P22307 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCP2P22307 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCP2P22307 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCP2P22307 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SCP2P22307 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SCP2P22307 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SCP2P22307 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCP2P22307 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCP2P22307 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms