Protein–RNA interactions for Protein: P22090

RPS4Y1, 40S ribosomal protein S4, Y isoform 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4Y1P22090 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS4Y1P22090 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS4Y1P22090 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS4Y1P22090 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS4Y1P22090 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS4Y1P22090 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS4Y1P22090 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS4Y1P22090 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS4Y1P22090 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS4Y1P22090 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS4Y1P22090 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS4Y1P22090 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS4Y1P22090 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS4Y1P22090 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS4Y1P22090 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS4Y1P22090 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS4Y1P22090 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS4Y1P22090 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS4Y1P22090 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS4Y1P22090 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS4Y1P22090 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS4Y1P22090 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS4Y1P22090 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS4Y1P22090 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS4Y1P22090 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS4Y1P22090 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS4Y1P22090 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS4Y1P22090 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS4Y1P22090 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS4Y1P22090 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS4Y1P22090 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS4Y1P22090 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS4Y1P22090 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS4Y1P22090 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS4Y1P22090 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS4Y1P22090 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS4Y1P22090 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS4Y1P22090 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS4Y1P22090 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS4Y1P22090 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS4Y1P22090 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS4Y1P22090 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS4Y1P22090 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS4Y1P22090 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS4Y1P22090 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS4Y1P22090 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS4Y1P22090 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS4Y1P22090 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS4Y1P22090 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS4Y1P22090 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS4Y1P22090 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS4Y1P22090 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS4Y1P22090 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPS4Y1P22090 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS4Y1P22090 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS4Y1P22090 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS4Y1P22090 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS4Y1P22090 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS4Y1P22090 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS4Y1P22090 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS4Y1P22090 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS4Y1P22090 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS4Y1P22090 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS4Y1P22090 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS4Y1P22090 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS4Y1P22090 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS4Y1P22090 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS4Y1P22090 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS4Y1P22090 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS4Y1P22090 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS4Y1P22090 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS4Y1P22090 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS4Y1P22090 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS4Y1P22090 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS4Y1P22090 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS4Y1P22090 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS4Y1P22090 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS4Y1P22090 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPS4Y1P22090 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPS4Y1P22090 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS4Y1P22090 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS4Y1P22090 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS4Y1P22090 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS4Y1P22090 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS4Y1P22090 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS4Y1P22090 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS4Y1P22090 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS4Y1P22090 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS4Y1P22090 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS4Y1P22090 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS4Y1P22090 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS4Y1P22090 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS4Y1P22090 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS4Y1P22090 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS4Y1P22090 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS4Y1P22090 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS4Y1P22090 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS4Y1P22090 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS4Y1P22090 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS4Y1P22090 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms