Protein–RNA interactions for Protein: P21796

VDAC1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC1P21796 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VDAC1P21796 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VDAC1P21796 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VDAC1P21796 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VDAC1P21796 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VDAC1P21796 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VDAC1P21796 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VDAC1P21796 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VDAC1P21796 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VDAC1P21796 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VDAC1P21796 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VDAC1P21796 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VDAC1P21796 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VDAC1P21796 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VDAC1P21796 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VDAC1P21796 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VDAC1P21796 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
VDAC1P21796 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VDAC1P21796 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VDAC1P21796 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VDAC1P21796 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VDAC1P21796 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VDAC1P21796 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VDAC1P21796 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VDAC1P21796 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VDAC1P21796 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VDAC1P21796 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VDAC1P21796 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VDAC1P21796 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VDAC1P21796 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VDAC1P21796 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VDAC1P21796 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VDAC1P21796 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VDAC1P21796 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VDAC1P21796 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VDAC1P21796 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VDAC1P21796 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VDAC1P21796 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VDAC1P21796 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VDAC1P21796 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VDAC1P21796 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VDAC1P21796 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VDAC1P21796 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VDAC1P21796 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VDAC1P21796 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VDAC1P21796 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VDAC1P21796 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VDAC1P21796 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VDAC1P21796 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VDAC1P21796 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VDAC1P21796 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VDAC1P21796 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VDAC1P21796 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VDAC1P21796 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VDAC1P21796 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VDAC1P21796 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VDAC1P21796 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VDAC1P21796 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VDAC1P21796 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VDAC1P21796 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VDAC1P21796 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VDAC1P21796 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VDAC1P21796 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VDAC1P21796 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VDAC1P21796 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VDAC1P21796 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VDAC1P21796 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VDAC1P21796 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VDAC1P21796 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VDAC1P21796 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VDAC1P21796 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VDAC1P21796 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VDAC1P21796 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VDAC1P21796 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VDAC1P21796 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VDAC1P21796 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
VDAC1P21796 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VDAC1P21796 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VDAC1P21796 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VDAC1P21796 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VDAC1P21796 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VDAC1P21796 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VDAC1P21796 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VDAC1P21796 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VDAC1P21796 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VDAC1P21796 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VDAC1P21796 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VDAC1P21796 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VDAC1P21796 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VDAC1P21796 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VDAC1P21796 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VDAC1P21796 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VDAC1P21796 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VDAC1P21796 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VDAC1P21796 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VDAC1P21796 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VDAC1P21796 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VDAC1P21796 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VDAC1P21796 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VDAC1P21796 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms