Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCB4P21439 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCB4P21439 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCB4P21439 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCB4P21439 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCB4P21439 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCB4P21439 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCB4P21439 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCB4P21439 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCB4P21439 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCB4P21439 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCB4P21439 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCB4P21439 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCB4P21439 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCB4P21439 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCB4P21439 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCB4P21439 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCB4P21439 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCB4P21439 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCB4P21439 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCB4P21439 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCB4P21439 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCB4P21439 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCB4P21439 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCB4P21439 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCB4P21439 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCB4P21439 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCB4P21439 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCB4P21439 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCB4P21439 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCB4P21439 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCB4P21439 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCB4P21439 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCB4P21439 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCB4P21439 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCB4P21439 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCB4P21439 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCB4P21439 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCB4P21439 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCB4P21439 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCB4P21439 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCB4P21439 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCB4P21439 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCB4P21439 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCB4P21439 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCB4P21439 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCB4P21439 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCB4P21439 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCB4P21439 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCB4P21439 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCB4P21439 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCB4P21439 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCB4P21439 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCB4P21439 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ABCB4P21439 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCB4P21439 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCB4P21439 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCB4P21439 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCB4P21439 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCB4P21439 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCB4P21439 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCB4P21439 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCB4P21439 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCB4P21439 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCB4P21439 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCB4P21439 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCB4P21439 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCB4P21439 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCB4P21439 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCB4P21439 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCB4P21439 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCB4P21439 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCB4P21439 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCB4P21439 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCB4P21439 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCB4P21439 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCB4P21439 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCB4P21439 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCB4P21439 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCB4P21439 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCB4P21439 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCB4P21439 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCB4P21439 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCB4P21439 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCB4P21439 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCB4P21439 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCB4P21439 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCB4P21439 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ABCB4P21439 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCB4P21439 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCB4P21439 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCB4P21439 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCB4P21439 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCB4P21439 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCB4P21439 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCB4P21439 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCB4P21439 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCB4P21439 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCB4P21439 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCB4P21439 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms