Protein–RNA interactions for Protein: P21283

ATP6V1C1, V-type proton ATPase subunit C 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1C1P21283 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP6V1C1P21283 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP6V1C1P21283 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP6V1C1P21283 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP6V1C1P21283 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP6V1C1P21283 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP6V1C1P21283 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP6V1C1P21283 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP6V1C1P21283 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP6V1C1P21283 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP6V1C1P21283 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP6V1C1P21283 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP6V1C1P21283 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP6V1C1P21283 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP6V1C1P21283 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP6V1C1P21283 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP6V1C1P21283 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP6V1C1P21283 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP6V1C1P21283 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP6V1C1P21283 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP6V1C1P21283 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP6V1C1P21283 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP6V1C1P21283 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP6V1C1P21283 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP6V1C1P21283 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP6V1C1P21283 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP6V1C1P21283 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP6V1C1P21283 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP6V1C1P21283 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP6V1C1P21283 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP6V1C1P21283 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP6V1C1P21283 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP6V1C1P21283 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP6V1C1P21283 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP6V1C1P21283 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP6V1C1P21283 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP6V1C1P21283 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP6V1C1P21283 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP6V1C1P21283 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP6V1C1P21283 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP6V1C1P21283 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP6V1C1P21283 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP6V1C1P21283 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP6V1C1P21283 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP6V1C1P21283 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP6V1C1P21283 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP6V1C1P21283 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP6V1C1P21283 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP6V1C1P21283 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP6V1C1P21283 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP6V1C1P21283 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP6V1C1P21283 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP6V1C1P21283 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP6V1C1P21283 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP6V1C1P21283 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP6V1C1P21283 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP6V1C1P21283 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP6V1C1P21283 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP6V1C1P21283 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP6V1C1P21283 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP6V1C1P21283 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP6V1C1P21283 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP6V1C1P21283 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP6V1C1P21283 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP6V1C1P21283 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP6V1C1P21283 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP6V1C1P21283 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP6V1C1P21283 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP6V1C1P21283 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP6V1C1P21283 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP6V1C1P21283 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP6V1C1P21283 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP6V1C1P21283 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP6V1C1P21283 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP6V1C1P21283 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP6V1C1P21283 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP6V1C1P21283 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP6V1C1P21283 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP6V1C1P21283 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP6V1C1P21283 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP6V1C1P21283 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP6V1C1P21283 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP6V1C1P21283 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP6V1C1P21283 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP6V1C1P21283 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP6V1C1P21283 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP6V1C1P21283 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP6V1C1P21283 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP6V1C1P21283 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP6V1C1P21283 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP6V1C1P21283 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP6V1C1P21283 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP6V1C1P21283 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP6V1C1P21283 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP6V1C1P21283 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP6V1C1P21283 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP6V1C1P21283 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP6V1C1P21283 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP6V1C1P21283 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP6V1C1P21283 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms