Protein–RNA interactions for Protein: P21242

PRE10, Probable proteasome subunit alpha type-7, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRE10P21242 YGR139WYGR139W 339 nt10.4□□□□□ -0.74
PRE10P21242 CCT5YJR064W 1689 nt10.39□□□□□ -0.75
PRE10P21242 PRM5YIL117C 957 nt10.39□□□□□ -0.75
PRE10P21242 YJL055WYJL055W 738 nt10.37□□□□□ -0.75
PRE10P21242 HEL2YDR266C 1920 nt10.37□□□□□ -0.75
PRE10P21242 UTR1YJR049C 1593 nt10.35□□□□□ -0.75
PRE10P21242 UGA4YDL210W 1716 nt10.35□□□□□ -0.75
PRE10P21242 RIB1YBL033C 1038 nt10.34□□□□□ -0.75
PRE10P21242 TAF13YML098W 504 nt10.31□□□□□ -0.76
PRE10P21242 SED1YDR077W 1017 nt10.29□□□□□ -0.76
PRE10P21242 RIM8YGL045W 1629 nt10.29□□□□□ -0.76
PRE10P21242 THI72YOR192C 1800 nt10.28□□□□□ -0.76
PRE10P21242 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.28□□□□□ -0.76
PRE10P21242 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.28□□□□□ -0.76
PRE10P21242 ERG6YML008C 1152 nt10.28□□□□□ -0.76
PRE10P21242 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.28□□□□□ -0.76
PRE10P21242 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.28□□□□□ -0.76
PRE10P21242 TIP1YBR067C 633 nt10.28□□□□□ -0.76
PRE10P21242 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.28□□□□□ -0.76
PRE10P21242 MUP1YGR055W 1725 nt10.25□□□□□ -0.77
PRE10P21242 SAM35YHR083W 990 nt10.25□□□□□ -0.77
PRE10P21242 SOD2YHR008C 702 nt10.24□□□□□ -0.77
PRE10P21242 PAR32YDL173W 888 nt10.23□□□□□ -0.77
PRE10P21242 YIA6YIL006W 1122 nt10.23□□□□□ -0.77
PRE10P21242 YGL114WYGL114W 2178 nt10.22□□□□□ -0.77
PRE10P21242 YMR262WYMR262W 942 nt10.21□□□□□ -0.77
PRE10P21242 CSM1YCR086W 573 nt10.2□□□□□ -0.78
PRE10P21242 LIP1YMR298W 453 nt10.19□□□□□ -0.78
PRE10P21242 LSB5YCL034W 1065 nt10.19□□□□□ -0.78
PRE10P21242 HOL1YNR055C 1761 nt10.18□□□□□ -0.78
PRE10P21242 GAL3YDR009W 1563 nt10.18□□□□□ -0.78
PRE10P21242 ZRT3YKL175W 1512 nt10.17□□□□□ -0.78
PRE10P21242 YJL118WYJL118W 660 nt10.16□□□□□ -0.78
PRE10P21242 YPL251WYPL251W 303 nt10.15□□□□□ -0.78
PRE10P21242 TUB4YLR212C 1422 nt10.15□□□□□ -0.79
PRE10P21242 RIB7YBR153W 735 nt10.14□□□□□ -0.79
PRE10P21242 MEP3YPR138C 1470 nt10.14□□□□□ -0.79
PRE10P21242 GSF2YML048W 1212 nt10.13□□□□□ -0.79
PRE10P21242 YJL067WYJL067W 351 nt10.12□□□□□ -0.79
PRE10P21242 RPT5YOR117W 1305 nt10.11□□□□□ -0.79
PRE10P21242 POT1YIL160C 1254 nt10.11□□□□□ -0.79
PRE10P21242 SNZ1YMR096W 894 nt10.11□□□□□ -0.79
PRE10P21242 YMR103CYMR103C 363 nt10.11□□□□□ -0.79
PRE10P21242 MHF1YOL086W-A 273 nt10.11□□□□□ -0.79
PRE10P21242 DBP1YPL119C 1854 nt10.09□□□□□ -0.79
PRE10P21242 NUC1YJL208C 990 nt10.09□□□□□ -0.79
PRE10P21242 BRR1YPR057W 1026 nt10.09□□□□□ -0.79
PRE10P21242 QDR2YIL121W 1629 nt10.07□□□□□ -0.8
PRE10P21242 POP2YNR052C 1302 nt10.07□□□□□ -0.8
PRE10P21242 LEU9YOR108W 1815 nt10.06□□□□□ -0.8
PRE10P21242 HXT1YHR094C 1713 nt10.06□□□□□ -0.8
PRE10P21242 SSN3YPL042C 1668 nt10.06□□□□□ -0.8
PRE10P21242 YCP4YCR004C 744 nt10.05□□□□□ -0.8
PRE10P21242 TOA2YKL058W 369 nt10.05□□□□□ -0.8
PRE10P21242 SAM3YPL274W 1764 nt10.05□□□□□ -0.8
PRE10P21242 YBL086CYBL086C 1401 nt10.05□□□□□ -0.8
PRE10P21242 MAE1YKL029C 2010 nt10.04□□□□□ -0.8
PRE10P21242 APS2YJR058C 444 nt10.04□□□□□ -0.8
PRE10P21242 NME1NME1 340 nt10.04□□□□□ -0.8
PRE10P21242 YER152W-AYER152W-A 567 nt10.03□□□□□ -0.8
PRE10P21242 YPR126CYPR126C 309 nt10.03□□□□□ -0.8 RIP-Chip
PRE10P21242 YNL024CYNL024C 741 nt10.02□□□□□ -0.81
PRE10P21242 CTI6YPL181W 1521 nt10.02□□□□□ -0.81 RIP-Chip
PRE10P21242 ILV3YJR016C 1758 nt10.01□□□□□ -0.81
PRE10P21242 PHO23YNL097C 993 nt10.01□□□□□ -0.81
PRE10P21242 BNI5YNL166C 1347 nt10.01□□□□□ -0.81
PRE10P21242 SAM50YNL026W 1455 nt9.99□□□□□ -0.81
PRE10P21242 YOR325WYOR325W 474 nt9.99□□□□□ -0.81
PRE10P21242 IML3YBR107C 738 nt9.98□□□□□ -0.81
PRE10P21242 NIF3YGL221C 867 nt9.97□□□□□ -0.81
PRE10P21242 SHY1YGR112W 1170 nt9.97□□□□□ -0.81
PRE10P21242 GND2YGR256W 1479 nt9.96□□□□□ -0.82
PRE10P21242 TPS1YBR126C 1488 nt9.96□□□□□ -0.82
PRE10P21242 MSC1YML128C 1542 nt9.96□□□□□ -0.82
PRE10P21242 DAK2YFL053W 1776 nt9.96□□□□□ -0.82
PRE10P21242 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.95□□□□□ -0.82
PRE10P21242 IGD1YFR017C 588 nt9.94□□□□□ -0.82
PRE10P21242 KRE1YNL322C 942 nt9.94□□□□□ -0.82
PRE10P21242 BUD20YLR074C 501 nt9.93□□□□□ -0.82
PRE10P21242 OYE2YHR179W 1203 nt9.91□□□□□ -0.82
PRE10P21242 SEC61YLR378C 1443 nt9.9□□□□□ -0.82
PRE10P21242 YMR209CYMR209C 1374 nt9.9□□□□□ -0.82
PRE10P21242 RAS2YNL098C 969 nt9.9□□□□□ -0.82
PRE10P21242 ACO2YJL200C 2370 nt9.89□□□□□ -0.83
PRE10P21242 COQ8YGL119W 1506 nt9.89□□□□□ -0.83
PRE10P21242 UGP1YKL035W 1500 nt9.89□□□□□ -0.83
PRE10P21242 YCR025CYCR025C 411 nt9.89□□□□□ -0.83
PRE10P21242 SAM2YDR502C 1155 nt9.89□□□□□ -0.83
PRE10P21242 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.89□□□□□ -0.83
PRE10P21242 UFO1YML088W 2007 nt9.87□□□□□ -0.83
PRE10P21242 OXA1YER154W 1209 nt9.87□□□□□ -0.83
PRE10P21242 URA6YKL024C 615 nt9.87□□□□□ -0.83
PRE10P21242 IPL1YPL209C 1104 nt9.86□□□□□ -0.83
PRE10P21242 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt9.85□□□□□ -0.83
PRE10P21242 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt9.85□□□□□ -0.83
PRE10P21242 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt9.85□□□□□ -0.83
PRE10P21242 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt9.85□□□□□ -0.83
PRE10P21242 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt9.85□□□□□ -0.83
PRE10P21242 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt9.85□□□□□ -0.83
PRE10P21242 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.2 ms