Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATP2B1P20020 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATP2B1P20020 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATP2B1P20020 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATP2B1P20020 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATP2B1P20020 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATP2B1P20020 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATP2B1P20020 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATP2B1P20020 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATP2B1P20020 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATP2B1P20020 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATP2B1P20020 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATP2B1P20020 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATP2B1P20020 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATP2B1P20020 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATP2B1P20020 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATP2B1P20020 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATP2B1P20020 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATP2B1P20020 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATP2B1P20020 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATP2B1P20020 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ATP2B1P20020 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ATP2B1P20020 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATP2B1P20020 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATP2B1P20020 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ATP2B1P20020 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATP2B1P20020 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATP2B1P20020 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATP2B1P20020 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATP2B1P20020 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATP2B1P20020 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATP2B1P20020 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATP2B1P20020 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATP2B1P20020 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
ATP2B1P20020 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP2B1P20020 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP2B1P20020 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP2B1P20020 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ATP2B1P20020 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ATP2B1P20020 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ATP2B1P20020 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ATP2B1P20020 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
ATP2B1P20020 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ATP2B1P20020 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
ATP2B1P20020 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATP2B1P20020 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATP2B1P20020 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATP2B1P20020 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATP2B1P20020 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATP2B1P20020 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATP2B1P20020 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATP2B1P20020 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ATP2B1P20020 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ATP2B1P20020 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATP2B1P20020 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATP2B1P20020 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATP2B1P20020 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATP2B1P20020 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATP2B1P20020 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATP2B1P20020 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATP2B1P20020 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATP2B1P20020 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATP2B1P20020 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP2B1P20020 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP2B1P20020 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP2B1P20020 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ATP2B1P20020 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP2B1P20020 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP2B1P20020 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATP2B1P20020 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP2B1P20020 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP2B1P20020 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP2B1P20020 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP2B1P20020 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ATP2B1P20020 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ATP2B1P20020 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATP2B1P20020 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ATP2B1P20020 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ATP2B1P20020 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ATP2B1P20020 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ATP2B1P20020 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ATP2B1P20020 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ATP2B1P20020 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP2B1P20020 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP2B1P20020 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP2B1P20020 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP2B1P20020 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP2B1P20020 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP2B1P20020 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP2B1P20020 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP2B1P20020 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP2B1P20020 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP2B1P20020 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP2B1P20020 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP2B1P20020 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP2B1P20020 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP2B1P20020 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATP2B1P20020 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATP2B1P20020 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP2B1P20020 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms