Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NCLP19338 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NCLP19338 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NCLP19338 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NCLP19338 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NCLP19338 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NCLP19338 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NCLP19338 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NCLP19338 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NCLP19338 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NCLP19338 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NCLP19338 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NCLP19338 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NCLP19338 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NCLP19338 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NCLP19338 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NCLP19338 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NCLP19338 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NCLP19338 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NCLP19338 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NCLP19338 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NCLP19338 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NCLP19338 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NCLP19338 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NCLP19338 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NCLP19338 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NCLP19338 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NCLP19338 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NCLP19338 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NCLP19338 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NCLP19338 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NCLP19338 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NCLP19338 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NCLP19338 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NCLP19338 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NCLP19338 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NCLP19338 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NCLP19338 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NCLP19338 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NCLP19338 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
NCLP19338 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NCLP19338 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NCLP19338 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NCLP19338 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NCLP19338 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NCLP19338 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NCLP19338 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NCLP19338 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NCLP19338 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NCLP19338 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NCLP19338 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NCLP19338 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NCLP19338 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NCLP19338 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NCLP19338 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NCLP19338 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NCLP19338 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NCLP19338 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
NCLP19338 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NCLP19338 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NCLP19338 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NCLP19338 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NCLP19338 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NCLP19338 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NCLP19338 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NCLP19338 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NCLP19338 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NCLP19338 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NCLP19338 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NCLP19338 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
NCLP19338 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NCLP19338 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NCLP19338 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NCLP19338 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NCLP19338 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NCLP19338 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NCLP19338 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NCLP19338 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NCLP19338 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NCLP19338 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NCLP19338 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NCLP19338 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NCLP19338 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NCLP19338 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NCLP19338 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NCLP19338 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NCLP19338 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NCLP19338 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NCLP19338 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NCLP19338 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NCLP19338 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NCLP19338 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NCLP19338 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NCLP19338 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NCLP19338 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NCLP19338 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NCLP19338 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NCLP19338 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NCLP19338 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NCLP19338 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms