Protein–RNA interactions for Protein: P17612

PRKACA, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACAP17612 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKACAP17612 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKACAP17612 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKACAP17612 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKACAP17612 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKACAP17612 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKACAP17612 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKACAP17612 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKACAP17612 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKACAP17612 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKACAP17612 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKACAP17612 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKACAP17612 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKACAP17612 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKACAP17612 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKACAP17612 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKACAP17612 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKACAP17612 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKACAP17612 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKACAP17612 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKACAP17612 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKACAP17612 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKACAP17612 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKACAP17612 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKACAP17612 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKACAP17612 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKACAP17612 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKACAP17612 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKACAP17612 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKACAP17612 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKACAP17612 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKACAP17612 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKACAP17612 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKACAP17612 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKACAP17612 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKACAP17612 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKACAP17612 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKACAP17612 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKACAP17612 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKACAP17612 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKACAP17612 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKACAP17612 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKACAP17612 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKACAP17612 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKACAP17612 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKACAP17612 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKACAP17612 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKACAP17612 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKACAP17612 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKACAP17612 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKACAP17612 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKACAP17612 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKACAP17612 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKACAP17612 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKACAP17612 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKACAP17612 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKACAP17612 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKACAP17612 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKACAP17612 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKACAP17612 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKACAP17612 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKACAP17612 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKACAP17612 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKACAP17612 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKACAP17612 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKACAP17612 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKACAP17612 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKACAP17612 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKACAP17612 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKACAP17612 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKACAP17612 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKACAP17612 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKACAP17612 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKACAP17612 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKACAP17612 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKACAP17612 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKACAP17612 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKACAP17612 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKACAP17612 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKACAP17612 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKACAP17612 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKACAP17612 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKACAP17612 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKACAP17612 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKACAP17612 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKACAP17612 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKACAP17612 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKACAP17612 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKACAP17612 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKACAP17612 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKACAP17612 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKACAP17612 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKACAP17612 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKACAP17612 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKACAP17612 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKACAP17612 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKACAP17612 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKACAP17612 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKACAP17612 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKACAP17612 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms