Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXB8P17481 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HOXB8P17481 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HOXB8P17481 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HOXB8P17481 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXB8P17481 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXB8P17481 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXB8P17481 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXB8P17481 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXB8P17481 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXB8P17481 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXB8P17481 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXB8P17481 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXB8P17481 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXB8P17481 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXB8P17481 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXB8P17481 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXB8P17481 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXB8P17481 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXB8P17481 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXB8P17481 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXB8P17481 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXB8P17481 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXB8P17481 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXB8P17481 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXB8P17481 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXB8P17481 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXB8P17481 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXB8P17481 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXB8P17481 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXB8P17481 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXB8P17481 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXB8P17481 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXB8P17481 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXB8P17481 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXB8P17481 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXB8P17481 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXB8P17481 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXB8P17481 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXB8P17481 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXB8P17481 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXB8P17481 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXB8P17481 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXB8P17481 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXB8P17481 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXB8P17481 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXB8P17481 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXB8P17481 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXB8P17481 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXB8P17481 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXB8P17481 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXB8P17481 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXB8P17481 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXB8P17481 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXB8P17481 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXB8P17481 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXB8P17481 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXB8P17481 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXB8P17481 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXB8P17481 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXB8P17481 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXB8P17481 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXB8P17481 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXB8P17481 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXB8P17481 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXB8P17481 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXB8P17481 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXB8P17481 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXB8P17481 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXB8P17481 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXB8P17481 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXB8P17481 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXB8P17481 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXB8P17481 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXB8P17481 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXB8P17481 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXB8P17481 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXB8P17481 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXB8P17481 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXB8P17481 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXB8P17481 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXB8P17481 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXB8P17481 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXB8P17481 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXB8P17481 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXB8P17481 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXB8P17481 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXB8P17481 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXB8P17481 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXB8P17481 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXB8P17481 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXB8P17481 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
HOXB8P17481 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXB8P17481 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXB8P17481 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXB8P17481 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXB8P17481 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXB8P17481 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXB8P17481 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXB8P17481 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms