Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IL7RP16871 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IL7RP16871 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IL7RP16871 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IL7RP16871 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IL7RP16871 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IL7RP16871 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IL7RP16871 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IL7RP16871 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IL7RP16871 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IL7RP16871 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IL7RP16871 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IL7RP16871 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IL7RP16871 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IL7RP16871 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IL7RP16871 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IL7RP16871 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IL7RP16871 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IL7RP16871 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IL7RP16871 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IL7RP16871 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IL7RP16871 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IL7RP16871 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IL7RP16871 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IL7RP16871 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IL7RP16871 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IL7RP16871 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IL7RP16871 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IL7RP16871 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IL7RP16871 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IL7RP16871 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IL7RP16871 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IL7RP16871 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IL7RP16871 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IL7RP16871 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IL7RP16871 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IL7RP16871 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IL7RP16871 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IL7RP16871 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IL7RP16871 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IL7RP16871 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IL7RP16871 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IL7RP16871 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IL7RP16871 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IL7RP16871 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IL7RP16871 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IL7RP16871 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IL7RP16871 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IL7RP16871 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IL7RP16871 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IL7RP16871 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IL7RP16871 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IL7RP16871 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IL7RP16871 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IL7RP16871 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IL7RP16871 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IL7RP16871 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IL7RP16871 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IL7RP16871 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IL7RP16871 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IL7RP16871 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IL7RP16871 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IL7RP16871 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IL7RP16871 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IL7RP16871 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IL7RP16871 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IL7RP16871 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IL7RP16871 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IL7RP16871 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IL7RP16871 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IL7RP16871 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IL7RP16871 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IL7RP16871 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IL7RP16871 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IL7RP16871 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IL7RP16871 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IL7RP16871 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IL7RP16871 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IL7RP16871 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IL7RP16871 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IL7RP16871 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IL7RP16871 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IL7RP16871 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IL7RP16871 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IL7RP16871 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IL7RP16871 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IL7RP16871 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IL7RP16871 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IL7RP16871 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IL7RP16871 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IL7RP16871 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IL7RP16871 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IL7RP16871 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IL7RP16871 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IL7RP16871 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IL7RP16871 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IL7RP16871 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IL7RP16871 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IL7RP16871 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IL7RP16871 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms