Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EPB42P16452 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EPB42P16452 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EPB42P16452 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EPB42P16452 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPB42P16452 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPB42P16452 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPB42P16452 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPB42P16452 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPB42P16452 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPB42P16452 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPB42P16452 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPB42P16452 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPB42P16452 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPB42P16452 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPB42P16452 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPB42P16452 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPB42P16452 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPB42P16452 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPB42P16452 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPB42P16452 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPB42P16452 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
EPB42P16452 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPB42P16452 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPB42P16452 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EPB42P16452 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EPB42P16452 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EPB42P16452 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPB42P16452 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPB42P16452 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EPB42P16452 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EPB42P16452 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EPB42P16452 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EPB42P16452 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EPB42P16452 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPB42P16452 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPB42P16452 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPB42P16452 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPB42P16452 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPB42P16452 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EPB42P16452 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EPB42P16452 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EPB42P16452 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPB42P16452 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPB42P16452 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPB42P16452 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPB42P16452 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPB42P16452 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPB42P16452 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPB42P16452 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPB42P16452 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPB42P16452 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPB42P16452 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EPB42P16452 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EPB42P16452 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EPB42P16452 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPB42P16452 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EPB42P16452 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPB42P16452 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPB42P16452 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPB42P16452 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EPB42P16452 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EPB42P16452 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPB42P16452 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPB42P16452 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPB42P16452 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPB42P16452 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPB42P16452 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPB42P16452 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPB42P16452 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPB42P16452 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPB42P16452 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EPB42P16452 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EPB42P16452 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EPB42P16452 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EPB42P16452 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPB42P16452 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EPB42P16452 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPB42P16452 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPB42P16452 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPB42P16452 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPB42P16452 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPB42P16452 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPB42P16452 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPB42P16452 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPB42P16452 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPB42P16452 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPB42P16452 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPB42P16452 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPB42P16452 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPB42P16452 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPB42P16452 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPB42P16452 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPB42P16452 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPB42P16452 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPB42P16452 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPB42P16452 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPB42P16452 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPB42P16452 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
EPB42P16452 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms