Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2F2P13984 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2F2P13984 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2F2P13984 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2F2P13984 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2F2P13984 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2F2P13984 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2F2P13984 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2F2P13984 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2F2P13984 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2F2P13984 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2F2P13984 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2F2P13984 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2F2P13984 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2F2P13984 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2F2P13984 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2F2P13984 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2F2P13984 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2F2P13984 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2F2P13984 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2F2P13984 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2F2P13984 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2F2P13984 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2F2P13984 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2F2P13984 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2F2P13984 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2F2P13984 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2F2P13984 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2F2P13984 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2F2P13984 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2F2P13984 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2F2P13984 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2F2P13984 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2F2P13984 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2F2P13984 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2F2P13984 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2F2P13984 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2F2P13984 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2F2P13984 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2F2P13984 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2F2P13984 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2F2P13984 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2F2P13984 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2F2P13984 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2F2P13984 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2F2P13984 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2F2P13984 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2F2P13984 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2F2P13984 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2F2P13984 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2F2P13984 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2F2P13984 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2F2P13984 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2F2P13984 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2F2P13984 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2F2P13984 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2F2P13984 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2F2P13984 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2F2P13984 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2F2P13984 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2F2P13984 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2F2P13984 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2F2P13984 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2F2P13984 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2F2P13984 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2F2P13984 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2F2P13984 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2F2P13984 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2F2P13984 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2F2P13984 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2F2P13984 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2F2P13984 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2F2P13984 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2F2P13984 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2F2P13984 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2F2P13984 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2F2P13984 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2F2P13984 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2F2P13984 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2F2P13984 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2F2P13984 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2F2P13984 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2F2P13984 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2F2P13984 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2F2P13984 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2F2P13984 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2F2P13984 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2F2P13984 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2F2P13984 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2F2P13984 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2F2P13984 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2F2P13984 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2F2P13984 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2F2P13984 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2F2P13984 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2F2P13984 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2F2P13984 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2F2P13984 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2F2P13984 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2F2P13984 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms