Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLS3P13797 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLS3P13797 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLS3P13797 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLS3P13797 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLS3P13797 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLS3P13797 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLS3P13797 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PLS3P13797 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PLS3P13797 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PLS3P13797 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PLS3P13797 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PLS3P13797 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PLS3P13797 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PLS3P13797 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLS3P13797 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLS3P13797 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PLS3P13797 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLS3P13797 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PLS3P13797 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PLS3P13797 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PLS3P13797 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PLS3P13797 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PLS3P13797 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PLS3P13797 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PLS3P13797 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PLS3P13797 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PLS3P13797 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PLS3P13797 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PLS3P13797 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLS3P13797 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLS3P13797 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLS3P13797 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLS3P13797 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLS3P13797 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PLS3P13797 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PLS3P13797 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PLS3P13797 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PLS3P13797 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PLS3P13797 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PLS3P13797 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLS3P13797 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PLS3P13797 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLS3P13797 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLS3P13797 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLS3P13797 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLS3P13797 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLS3P13797 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLS3P13797 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLS3P13797 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLS3P13797 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLS3P13797 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLS3P13797 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLS3P13797 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLS3P13797 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PLS3P13797 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PLS3P13797 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PLS3P13797 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PLS3P13797 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLS3P13797 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLS3P13797 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLS3P13797 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLS3P13797 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLS3P13797 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLS3P13797 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLS3P13797 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLS3P13797 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLS3P13797 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLS3P13797 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLS3P13797 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLS3P13797 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PLS3P13797 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PLS3P13797 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PLS3P13797 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLS3P13797 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLS3P13797 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PLS3P13797 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PLS3P13797 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PLS3P13797 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PLS3P13797 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PLS3P13797 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PLS3P13797 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PLS3P13797 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PLS3P13797 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLS3P13797 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLS3P13797 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLS3P13797 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLS3P13797 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLS3P13797 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLS3P13797 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLS3P13797 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLS3P13797 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLS3P13797 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PLS3P13797 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLS3P13797 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLS3P13797 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLS3P13797 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLS3P13797 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLS3P13797 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLS3P13797 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms