Protein–RNA interactions for Protein: P13473

LAMP2, Lysosome-associated membrane glycoprotein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP2P13473 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMP2P13473 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMP2P13473 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMP2P13473 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMP2P13473 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMP2P13473 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMP2P13473 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAMP2P13473 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAMP2P13473 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LAMP2P13473 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAMP2P13473 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMP2P13473 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMP2P13473 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMP2P13473 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMP2P13473 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMP2P13473 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMP2P13473 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMP2P13473 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMP2P13473 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMP2P13473 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMP2P13473 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMP2P13473 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMP2P13473 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMP2P13473 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMP2P13473 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMP2P13473 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMP2P13473 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMP2P13473 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMP2P13473 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMP2P13473 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMP2P13473 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMP2P13473 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMP2P13473 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMP2P13473 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMP2P13473 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMP2P13473 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMP2P13473 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMP2P13473 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LAMP2P13473 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LAMP2P13473 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMP2P13473 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMP2P13473 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMP2P13473 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMP2P13473 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMP2P13473 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMP2P13473 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMP2P13473 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMP2P13473 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMP2P13473 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMP2P13473 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMP2P13473 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMP2P13473 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMP2P13473 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMP2P13473 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMP2P13473 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMP2P13473 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMP2P13473 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMP2P13473 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMP2P13473 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMP2P13473 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMP2P13473 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMP2P13473 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMP2P13473 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LAMP2P13473 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMP2P13473 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMP2P13473 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMP2P13473 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMP2P13473 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMP2P13473 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMP2P13473 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMP2P13473 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMP2P13473 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMP2P13473 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMP2P13473 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMP2P13473 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMP2P13473 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMP2P13473 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMP2P13473 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LAMP2P13473 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LAMP2P13473 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMP2P13473 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMP2P13473 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMP2P13473 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMP2P13473 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMP2P13473 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMP2P13473 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMP2P13473 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMP2P13473 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMP2P13473 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMP2P13473 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMP2P13473 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMP2P13473 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMP2P13473 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMP2P13473 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMP2P13473 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMP2P13473 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMP2P13473 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMP2P13473 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMP2P13473 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMP2P13473 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms