Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COX4I1P13073 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COX4I1P13073 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COX4I1P13073 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COX4I1P13073 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COX4I1P13073 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COX4I1P13073 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COX4I1P13073 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COX4I1P13073 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COX4I1P13073 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COX4I1P13073 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COX4I1P13073 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COX4I1P13073 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COX4I1P13073 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COX4I1P13073 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COX4I1P13073 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COX4I1P13073 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COX4I1P13073 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
COX4I1P13073 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COX4I1P13073 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COX4I1P13073 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COX4I1P13073 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COX4I1P13073 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COX4I1P13073 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COX4I1P13073 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COX4I1P13073 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COX4I1P13073 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COX4I1P13073 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COX4I1P13073 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COX4I1P13073 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COX4I1P13073 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COX4I1P13073 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
COX4I1P13073 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COX4I1P13073 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COX4I1P13073 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COX4I1P13073 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COX4I1P13073 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COX4I1P13073 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COX4I1P13073 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COX4I1P13073 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COX4I1P13073 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COX4I1P13073 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COX4I1P13073 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COX4I1P13073 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COX4I1P13073 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COX4I1P13073 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COX4I1P13073 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COX4I1P13073 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COX4I1P13073 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COX4I1P13073 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COX4I1P13073 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COX4I1P13073 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
COX4I1P13073 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COX4I1P13073 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COX4I1P13073 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COX4I1P13073 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COX4I1P13073 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COX4I1P13073 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COX4I1P13073 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COX4I1P13073 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COX4I1P13073 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COX4I1P13073 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COX4I1P13073 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COX4I1P13073 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COX4I1P13073 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
COX4I1P13073 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COX4I1P13073 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COX4I1P13073 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COX4I1P13073 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COX4I1P13073 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COX4I1P13073 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
COX4I1P13073 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COX4I1P13073 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COX4I1P13073 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COX4I1P13073 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COX4I1P13073 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COX4I1P13073 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COX4I1P13073 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COX4I1P13073 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COX4I1P13073 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COX4I1P13073 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COX4I1P13073 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COX4I1P13073 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms