Protein–RNA interactions for Protein: P12757

SKIL, Ski-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKILP12757 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SKILP12757 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SKILP12757 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SKILP12757 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SKILP12757 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SKILP12757 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SKILP12757 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SKILP12757 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SKILP12757 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SKILP12757 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SKILP12757 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SKILP12757 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SKILP12757 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SKILP12757 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SKILP12757 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SKILP12757 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SKILP12757 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SKILP12757 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SKILP12757 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SKILP12757 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SKILP12757 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SKILP12757 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SKILP12757 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SKILP12757 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SKILP12757 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SKILP12757 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SKILP12757 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SKILP12757 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SKILP12757 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SKILP12757 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SKILP12757 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SKILP12757 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SKILP12757 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SKILP12757 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SKILP12757 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SKILP12757 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SKILP12757 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SKILP12757 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SKILP12757 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SKILP12757 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SKILP12757 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SKILP12757 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SKILP12757 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SKILP12757 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SKILP12757 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SKILP12757 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SKILP12757 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SKILP12757 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SKILP12757 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SKILP12757 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SKILP12757 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SKILP12757 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SKILP12757 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SKILP12757 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SKILP12757 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SKILP12757 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SKILP12757 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SKILP12757 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SKILP12757 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SKILP12757 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SKILP12757 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SKILP12757 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SKILP12757 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SKILP12757 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.24
SKILP12757 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SKILP12757 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SKILP12757 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SKILP12757 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SKILP12757 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SKILP12757 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SKILP12757 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SKILP12757 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SKILP12757 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SKILP12757 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SKILP12757 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SKILP12757 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SKILP12757 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SKILP12757 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SKILP12757 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SKILP12757 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SKILP12757 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SKILP12757 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SKILP12757 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SKILP12757 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SKILP12757 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SKILP12757 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SKILP12757 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SKILP12757 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SKILP12757 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SKILP12757 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SKILP12757 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SKILP12757 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SKILP12757 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SKILP12757 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SKILP12757 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SKILP12757 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SKILP12757 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SKILP12757 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SKILP12757 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SKILP12757 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms