Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFHP12036 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFHP12036 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFHP12036 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFHP12036 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEFHP12036 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEFHP12036 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEFHP12036 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFHP12036 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFHP12036 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFHP12036 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFHP12036 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFHP12036 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFHP12036 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFHP12036 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFHP12036 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFHP12036 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFHP12036 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEFHP12036 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEFHP12036 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEFHP12036 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFHP12036 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFHP12036 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFHP12036 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFHP12036 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFHP12036 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFHP12036 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEFHP12036 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEFHP12036 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEFHP12036 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEFHP12036 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEFHP12036 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEFHP12036 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEFHP12036 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEFHP12036 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEFHP12036 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEFHP12036 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEFHP12036 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEFHP12036 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFHP12036 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFHP12036 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFHP12036 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFHP12036 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFHP12036 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFHP12036 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFHP12036 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFHP12036 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFHP12036 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFHP12036 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFHP12036 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFHP12036 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFHP12036 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFHP12036 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFHP12036 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFHP12036 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFHP12036 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFHP12036 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFHP12036 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEFHP12036 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEFHP12036 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NEFHP12036 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEFHP12036 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFHP12036 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFHP12036 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFHP12036 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFHP12036 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFHP12036 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFHP12036 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEFHP12036 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEFHP12036 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFHP12036 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFHP12036 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFHP12036 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFHP12036 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFHP12036 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFHP12036 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFHP12036 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFHP12036 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFHP12036 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFHP12036 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEFHP12036 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEFHP12036 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEFHP12036 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFHP12036 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFHP12036 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFHP12036 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFHP12036 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFHP12036 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFHP12036 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFHP12036 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFHP12036 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFHP12036 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFHP12036 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFHP12036 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFHP12036 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFHP12036 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFHP12036 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFHP12036 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFHP12036 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFHP12036 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms