Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DMDP11532 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DMDP11532 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DMDP11532 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DMDP11532 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DMDP11532 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
DMDP11532 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
DMDP11532 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
DMDP11532 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DMDP11532 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DMDP11532 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DMDP11532 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DMDP11532 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DMDP11532 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DMDP11532 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DMDP11532 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DMDP11532 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DMDP11532 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DMDP11532 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DMDP11532 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DMDP11532 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DMDP11532 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DMDP11532 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DMDP11532 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DMDP11532 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DMDP11532 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DMDP11532 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DMDP11532 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DMDP11532 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DMDP11532 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DMDP11532 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DMDP11532 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DMDP11532 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DMDP11532 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DMDP11532 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DMDP11532 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DMDP11532 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DMDP11532 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DMDP11532 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DMDP11532 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DMDP11532 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DMDP11532 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DMDP11532 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DMDP11532 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DMDP11532 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DMDP11532 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
DMDP11532 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DMDP11532 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DMDP11532 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DMDP11532 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DMDP11532 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DMDP11532 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DMDP11532 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DMDP11532 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DMDP11532 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DMDP11532 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DMDP11532 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DMDP11532 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DMDP11532 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DMDP11532 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DMDP11532 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DMDP11532 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DMDP11532 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DMDP11532 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DMDP11532 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DMDP11532 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DMDP11532 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DMDP11532 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DMDP11532 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DMDP11532 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DMDP11532 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DMDP11532 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DMDP11532 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DMDP11532 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DMDP11532 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DMDP11532 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DMDP11532 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DMDP11532 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DMDP11532 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DMDP11532 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DMDP11532 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DMDP11532 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DMDP11532 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DMDP11532 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DMDP11532 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DMDP11532 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DMDP11532 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DMDP11532 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DMDP11532 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DMDP11532 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DMDP11532 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DMDP11532 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DMDP11532 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
DMDP11532 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
DMDP11532 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
DMDP11532 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DMDP11532 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DMDP11532 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DMDP11532 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DMDP11532 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.1 ms