Protein–RNA interactions for Protein: P10451

SPP1, Osteopontin, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP1P10451 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPP1P10451 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPP1P10451 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SPP1P10451 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPP1P10451 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPP1P10451 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPP1P10451 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SPP1P10451 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPP1P10451 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPP1P10451 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPP1P10451 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPP1P10451 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SPP1P10451 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPP1P10451 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPP1P10451 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPP1P10451 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPP1P10451 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPP1P10451 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPP1P10451 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPP1P10451 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPP1P10451 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPP1P10451 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPP1P10451 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPP1P10451 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPP1P10451 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPP1P10451 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPP1P10451 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPP1P10451 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPP1P10451 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPP1P10451 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPP1P10451 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPP1P10451 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPP1P10451 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPP1P10451 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPP1P10451 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPP1P10451 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPP1P10451 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPP1P10451 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPP1P10451 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPP1P10451 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPP1P10451 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPP1P10451 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPP1P10451 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPP1P10451 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPP1P10451 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPP1P10451 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPP1P10451 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPP1P10451 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPP1P10451 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPP1P10451 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPP1P10451 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPP1P10451 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPP1P10451 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPP1P10451 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPP1P10451 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPP1P10451 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPP1P10451 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPP1P10451 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPP1P10451 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPP1P10451 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPP1P10451 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPP1P10451 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPP1P10451 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPP1P10451 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPP1P10451 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPP1P10451 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPP1P10451 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPP1P10451 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPP1P10451 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPP1P10451 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPP1P10451 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPP1P10451 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPP1P10451 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPP1P10451 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPP1P10451 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPP1P10451 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPP1P10451 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPP1P10451 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPP1P10451 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPP1P10451 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPP1P10451 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPP1P10451 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPP1P10451 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPP1P10451 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPP1P10451 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPP1P10451 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPP1P10451 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPP1P10451 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPP1P10451 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPP1P10451 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPP1P10451 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPP1P10451 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPP1P10451 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPP1P10451 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPP1P10451 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPP1P10451 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPP1P10451 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPP1P10451 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPP1P10451 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SPP1P10451 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms