Protein–RNA interactions for Protein: P10253

GAA, Lysosomal alpha-glucosidase, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAAP10253 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GAAP10253 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GAAP10253 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GAAP10253 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GAAP10253 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAAP10253 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAAP10253 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAAP10253 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAAP10253 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAAP10253 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAAP10253 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAAP10253 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GAAP10253 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GAAP10253 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAAP10253 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAAP10253 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GAAP10253 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GAAP10253 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GAAP10253 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GAAP10253 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GAAP10253 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAAP10253 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAAP10253 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAAP10253 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAAP10253 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAAP10253 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAAP10253 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAAP10253 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GAAP10253 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GAAP10253 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GAAP10253 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GAAP10253 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GAAP10253 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GAAP10253 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GAAP10253 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GAAP10253 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GAAP10253 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
GAAP10253 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GAAP10253 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GAAP10253 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GAAP10253 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GAAP10253 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GAAP10253 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GAAP10253 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GAAP10253 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GAAP10253 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GAAP10253 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GAAP10253 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GAAP10253 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GAAP10253 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GAAP10253 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAAP10253 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAAP10253 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAAP10253 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GAAP10253 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
GAAP10253 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAAP10253 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAAP10253 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAAP10253 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAAP10253 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GAAP10253 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GAAP10253 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GAAP10253 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GAAP10253 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GAAP10253 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GAAP10253 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GAAP10253 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GAAP10253 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GAAP10253 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GAAP10253 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GAAP10253 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GAAP10253 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GAAP10253 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GAAP10253 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GAAP10253 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GAAP10253 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GAAP10253 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAAP10253 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAAP10253 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAAP10253 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAAP10253 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAAP10253 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAAP10253 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAAP10253 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAAP10253 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAAP10253 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAAP10253 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAAP10253 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAAP10253 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAAP10253 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAAP10253 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAAP10253 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAAP10253 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAAP10253 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GAAP10253 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAAP10253 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAAP10253 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAAP10253 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAAP10253 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAAP10253 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms