Protein–RNA interactions for Protein: P0DP91

CSB-PGBD3, Chimeric ERCC6-PGBD3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSB-PGBD3P0DP91 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
CSB-PGBD3P0DP91 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CSB-PGBD3P0DP91 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CSB-PGBD3P0DP91 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
CSB-PGBD3P0DP91 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
CSB-PGBD3P0DP91 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CSB-PGBD3P0DP91 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CSB-PGBD3P0DP91 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CSB-PGBD3P0DP91 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CSB-PGBD3P0DP91 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CSB-PGBD3P0DP91 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CSB-PGBD3P0DP91 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CSB-PGBD3P0DP91 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CSB-PGBD3P0DP91 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CSB-PGBD3P0DP91 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CSB-PGBD3P0DP91 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CSB-PGBD3P0DP91 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CSB-PGBD3P0DP91 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CSB-PGBD3P0DP91 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CSB-PGBD3P0DP91 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CSB-PGBD3P0DP91 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CSB-PGBD3P0DP91 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CSB-PGBD3P0DP91 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CSB-PGBD3P0DP91 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CSB-PGBD3P0DP91 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CSB-PGBD3P0DP91 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CSB-PGBD3P0DP91 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CSB-PGBD3P0DP91 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CSB-PGBD3P0DP91 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CSB-PGBD3P0DP91 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CSB-PGBD3P0DP91 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CSB-PGBD3P0DP91 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CSB-PGBD3P0DP91 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CSB-PGBD3P0DP91 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CSB-PGBD3P0DP91 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
CSB-PGBD3P0DP91 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CSB-PGBD3P0DP91 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CSB-PGBD3P0DP91 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CSB-PGBD3P0DP91 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CSB-PGBD3P0DP91 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CSB-PGBD3P0DP91 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CSB-PGBD3P0DP91 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
CSB-PGBD3P0DP91 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CSB-PGBD3P0DP91 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CSB-PGBD3P0DP91 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CSB-PGBD3P0DP91 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CSB-PGBD3P0DP91 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CSB-PGBD3P0DP91 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CSB-PGBD3P0DP91 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CSB-PGBD3P0DP91 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CSB-PGBD3P0DP91 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CSB-PGBD3P0DP91 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CSB-PGBD3P0DP91 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CSB-PGBD3P0DP91 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CSB-PGBD3P0DP91 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CSB-PGBD3P0DP91 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CSB-PGBD3P0DP91 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CSB-PGBD3P0DP91 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CSB-PGBD3P0DP91 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CSB-PGBD3P0DP91 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CSB-PGBD3P0DP91 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CSB-PGBD3P0DP91 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CSB-PGBD3P0DP91 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CSB-PGBD3P0DP91 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CSB-PGBD3P0DP91 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CSB-PGBD3P0DP91 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CSB-PGBD3P0DP91 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CSB-PGBD3P0DP91 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CSB-PGBD3P0DP91 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CSB-PGBD3P0DP91 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
CSB-PGBD3P0DP91 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CSB-PGBD3P0DP91 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CSB-PGBD3P0DP91 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CSB-PGBD3P0DP91 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CSB-PGBD3P0DP91 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CSB-PGBD3P0DP91 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CSB-PGBD3P0DP91 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CSB-PGBD3P0DP91 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CSB-PGBD3P0DP91 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CSB-PGBD3P0DP91 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CSB-PGBD3P0DP91 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CSB-PGBD3P0DP91 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CSB-PGBD3P0DP91 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CSB-PGBD3P0DP91 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CSB-PGBD3P0DP91 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CSB-PGBD3P0DP91 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CSB-PGBD3P0DP91 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CSB-PGBD3P0DP91 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CSB-PGBD3P0DP91 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CSB-PGBD3P0DP91 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CSB-PGBD3P0DP91 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CSB-PGBD3P0DP91 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CSB-PGBD3P0DP91 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CSB-PGBD3P0DP91 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CSB-PGBD3P0DP91 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CSB-PGBD3P0DP91 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CSB-PGBD3P0DP91 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CSB-PGBD3P0DP91 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CSB-PGBD3P0DP91 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
CSB-PGBD3P0DP91 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms