Protein–RNA interactions for Protein: P0CG36

CFC1B, Cryptic family protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1BP0CG36 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFC1BP0CG36 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFC1BP0CG36 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFC1BP0CG36 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFC1BP0CG36 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFC1BP0CG36 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFC1BP0CG36 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFC1BP0CG36 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFC1BP0CG36 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFC1BP0CG36 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFC1BP0CG36 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFC1BP0CG36 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFC1BP0CG36 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFC1BP0CG36 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFC1BP0CG36 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFC1BP0CG36 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFC1BP0CG36 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFC1BP0CG36 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFC1BP0CG36 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CFC1BP0CG36 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFC1BP0CG36 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFC1BP0CG36 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFC1BP0CG36 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CFC1BP0CG36 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFC1BP0CG36 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFC1BP0CG36 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFC1BP0CG36 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFC1BP0CG36 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFC1BP0CG36 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFC1BP0CG36 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFC1BP0CG36 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFC1BP0CG36 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFC1BP0CG36 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFC1BP0CG36 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFC1BP0CG36 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFC1BP0CG36 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFC1BP0CG36 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFC1BP0CG36 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFC1BP0CG36 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFC1BP0CG36 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFC1BP0CG36 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFC1BP0CG36 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFC1BP0CG36 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFC1BP0CG36 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFC1BP0CG36 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFC1BP0CG36 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFC1BP0CG36 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFC1BP0CG36 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFC1BP0CG36 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFC1BP0CG36 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFC1BP0CG36 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFC1BP0CG36 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFC1BP0CG36 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFC1BP0CG36 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFC1BP0CG36 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFC1BP0CG36 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFC1BP0CG36 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFC1BP0CG36 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFC1BP0CG36 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFC1BP0CG36 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFC1BP0CG36 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFC1BP0CG36 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFC1BP0CG36 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFC1BP0CG36 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFC1BP0CG36 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFC1BP0CG36 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFC1BP0CG36 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFC1BP0CG36 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFC1BP0CG36 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFC1BP0CG36 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFC1BP0CG36 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFC1BP0CG36 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFC1BP0CG36 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFC1BP0CG36 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFC1BP0CG36 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFC1BP0CG36 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFC1BP0CG36 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFC1BP0CG36 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFC1BP0CG36 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFC1BP0CG36 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFC1BP0CG36 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFC1BP0CG36 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFC1BP0CG36 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFC1BP0CG36 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFC1BP0CG36 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFC1BP0CG36 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFC1BP0CG36 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFC1BP0CG36 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFC1BP0CG36 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFC1BP0CG36 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFC1BP0CG36 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFC1BP0CG36 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFC1BP0CG36 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFC1BP0CG36 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFC1BP0CG36 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFC1BP0CG36 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFC1BP0CG36 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFC1BP0CG36 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFC1BP0CG36 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFC1BP0CG36 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms