Protein–RNA interactions for Protein: P0C860

MSL3P1, Putative male-specific lethal-3 protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3P1P0C860 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSL3P1P0C860 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSL3P1P0C860 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSL3P1P0C860 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSL3P1P0C860 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSL3P1P0C860 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSL3P1P0C860 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSL3P1P0C860 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSL3P1P0C860 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSL3P1P0C860 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSL3P1P0C860 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MSL3P1P0C860 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSL3P1P0C860 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSL3P1P0C860 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSL3P1P0C860 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSL3P1P0C860 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSL3P1P0C860 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSL3P1P0C860 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSL3P1P0C860 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSL3P1P0C860 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSL3P1P0C860 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSL3P1P0C860 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSL3P1P0C860 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSL3P1P0C860 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSL3P1P0C860 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSL3P1P0C860 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSL3P1P0C860 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSL3P1P0C860 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSL3P1P0C860 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSL3P1P0C860 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSL3P1P0C860 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSL3P1P0C860 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSL3P1P0C860 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSL3P1P0C860 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MSL3P1P0C860 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MSL3P1P0C860 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MSL3P1P0C860 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSL3P1P0C860 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSL3P1P0C860 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSL3P1P0C860 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSL3P1P0C860 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSL3P1P0C860 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSL3P1P0C860 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSL3P1P0C860 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSL3P1P0C860 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSL3P1P0C860 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSL3P1P0C860 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSL3P1P0C860 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSL3P1P0C860 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSL3P1P0C860 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSL3P1P0C860 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MSL3P1P0C860 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MSL3P1P0C860 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSL3P1P0C860 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSL3P1P0C860 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSL3P1P0C860 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSL3P1P0C860 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSL3P1P0C860 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSL3P1P0C860 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSL3P1P0C860 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSL3P1P0C860 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSL3P1P0C860 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MSL3P1P0C860 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSL3P1P0C860 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSL3P1P0C860 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSL3P1P0C860 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSL3P1P0C860 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSL3P1P0C860 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSL3P1P0C860 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSL3P1P0C860 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSL3P1P0C860 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSL3P1P0C860 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSL3P1P0C860 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSL3P1P0C860 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSL3P1P0C860 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSL3P1P0C860 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSL3P1P0C860 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSL3P1P0C860 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSL3P1P0C860 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSL3P1P0C860 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSL3P1P0C860 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSL3P1P0C860 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSL3P1P0C860 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSL3P1P0C860 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSL3P1P0C860 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MSL3P1P0C860 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MSL3P1P0C860 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSL3P1P0C860 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSL3P1P0C860 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSL3P1P0C860 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSL3P1P0C860 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSL3P1P0C860 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSL3P1P0C860 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSL3P1P0C860 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSL3P1P0C860 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSL3P1P0C860 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSL3P1P0C860 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MSL3P1P0C860 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSL3P1P0C860 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSL3P1P0C860 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms