Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFTA3P0C7M3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFTA3P0C7M3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFTA3P0C7M3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFTA3P0C7M3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFTA3P0C7M3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFTA3P0C7M3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFTA3P0C7M3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFTA3P0C7M3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFTA3P0C7M3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SFTA3P0C7M3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFTA3P0C7M3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFTA3P0C7M3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFTA3P0C7M3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFTA3P0C7M3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFTA3P0C7M3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFTA3P0C7M3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFTA3P0C7M3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFTA3P0C7M3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SFTA3P0C7M3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFTA3P0C7M3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SFTA3P0C7M3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFTA3P0C7M3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFTA3P0C7M3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFTA3P0C7M3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SFTA3P0C7M3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SFTA3P0C7M3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFTA3P0C7M3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SFTA3P0C7M3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFTA3P0C7M3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFTA3P0C7M3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SFTA3P0C7M3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SFTA3P0C7M3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFTA3P0C7M3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFTA3P0C7M3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SFTA3P0C7M3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFTA3P0C7M3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SFTA3P0C7M3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFTA3P0C7M3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFTA3P0C7M3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFTA3P0C7M3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFTA3P0C7M3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFTA3P0C7M3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFTA3P0C7M3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFTA3P0C7M3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFTA3P0C7M3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFTA3P0C7M3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFTA3P0C7M3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFTA3P0C7M3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFTA3P0C7M3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFTA3P0C7M3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFTA3P0C7M3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFTA3P0C7M3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFTA3P0C7M3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SFTA3P0C7M3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFTA3P0C7M3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFTA3P0C7M3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFTA3P0C7M3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFTA3P0C7M3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFTA3P0C7M3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFTA3P0C7M3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFTA3P0C7M3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFTA3P0C7M3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFTA3P0C7M3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFTA3P0C7M3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFTA3P0C7M3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFTA3P0C7M3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFTA3P0C7M3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFTA3P0C7M3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFTA3P0C7M3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFTA3P0C7M3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFTA3P0C7M3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFTA3P0C7M3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFTA3P0C7M3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFTA3P0C7M3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFTA3P0C7M3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SFTA3P0C7M3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFTA3P0C7M3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFTA3P0C7M3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFTA3P0C7M3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFTA3P0C7M3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFTA3P0C7M3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFTA3P0C7M3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFTA3P0C7M3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFTA3P0C7M3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFTA3P0C7M3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFTA3P0C7M3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFTA3P0C7M3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFTA3P0C7M3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFTA3P0C7M3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFTA3P0C7M3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFTA3P0C7M3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFTA3P0C7M3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SFTA3P0C7M3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFTA3P0C7M3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFTA3P0C7M3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFTA3P0C7M3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFTA3P0C7M3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFTA3P0C7M3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFTA3P0C7M3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms