Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP1P09430 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP1P09430 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP1P09430 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP1P09430 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP1P09430 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP1P09430 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP1P09430 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP1P09430 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP1P09430 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP1P09430 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP1P09430 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP1P09430 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP1P09430 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP1P09430 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP1P09430 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP1P09430 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP1P09430 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP1P09430 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP1P09430 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP1P09430 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP1P09430 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP1P09430 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP1P09430 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNP1P09430 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNP1P09430 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNP1P09430 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNP1P09430 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNP1P09430 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNP1P09430 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNP1P09430 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNP1P09430 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNP1P09430 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP1P09430 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TNP1P09430 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TNP1P09430 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TNP1P09430 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP1P09430 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP1P09430 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP1P09430 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP1P09430 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP1P09430 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP1P09430 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP1P09430 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP1P09430 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP1P09430 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP1P09430 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP1P09430 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP1P09430 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP1P09430 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP1P09430 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP1P09430 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP1P09430 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP1P09430 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP1P09430 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP1P09430 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP1P09430 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP1P09430 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP1P09430 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP1P09430 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP1P09430 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP1P09430 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP1P09430 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TNP1P09430 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP1P09430 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP1P09430 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP1P09430 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP1P09430 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP1P09430 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP1P09430 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP1P09430 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TNP1P09430 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP1P09430 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP1P09430 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP1P09430 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP1P09430 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP1P09430 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP1P09430 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP1P09430 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP1P09430 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP1P09430 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP1P09430 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP1P09430 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP1P09430 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP1P09430 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP1P09430 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP1P09430 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP1P09430 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP1P09430 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP1P09430 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP1P09430 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP1P09430 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP1P09430 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP1P09430 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP1P09430 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP1P09430 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP1P09430 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP1P09430 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP1P09430 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP1P09430 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms