Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT7P08729 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT7P08729 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT7P08729 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT7P08729 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT7P08729 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT7P08729 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT7P08729 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
KRT7P08729 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
KRT7P08729 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT7P08729 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT7P08729 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT7P08729 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT7P08729 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT7P08729 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT7P08729 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT7P08729 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT7P08729 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT7P08729 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT7P08729 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT7P08729 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT7P08729 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT7P08729 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT7P08729 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT7P08729 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT7P08729 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT7P08729 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT7P08729 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT7P08729 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT7P08729 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT7P08729 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT7P08729 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT7P08729 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT7P08729 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT7P08729 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT7P08729 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT7P08729 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT7P08729 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT7P08729 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT7P08729 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT7P08729 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT7P08729 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT7P08729 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT7P08729 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT7P08729 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT7P08729 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT7P08729 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT7P08729 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT7P08729 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT7P08729 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT7P08729 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KRT7P08729 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KRT7P08729 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT7P08729 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT7P08729 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT7P08729 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT7P08729 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT7P08729 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT7P08729 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT7P08729 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT7P08729 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT7P08729 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT7P08729 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT7P08729 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT7P08729 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT7P08729 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT7P08729 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KRT7P08729 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT7P08729 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT7P08729 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT7P08729 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT7P08729 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT7P08729 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT7P08729 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT7P08729 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT7P08729 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT7P08729 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT7P08729 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT7P08729 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT7P08729 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT7P08729 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT7P08729 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT7P08729 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT7P08729 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT7P08729 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT7P08729 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT7P08729 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT7P08729 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT7P08729 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT7P08729 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT7P08729 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT7P08729 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT7P08729 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT7P08729 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT7P08729 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT7P08729 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT7P08729 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT7P08729 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT7P08729 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT7P08729 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms