Protein–RNA interactions for Protein: P07384

CAPN1, Calpain-1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN1P07384 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN1P07384 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN1P07384 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN1P07384 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN1P07384 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN1P07384 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN1P07384 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN1P07384 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN1P07384 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN1P07384 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN1P07384 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN1P07384 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN1P07384 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN1P07384 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN1P07384 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN1P07384 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN1P07384 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN1P07384 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN1P07384 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN1P07384 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN1P07384 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN1P07384 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN1P07384 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN1P07384 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN1P07384 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN1P07384 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN1P07384 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN1P07384 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN1P07384 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN1P07384 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN1P07384 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN1P07384 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN1P07384 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN1P07384 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN1P07384 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN1P07384 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN1P07384 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAPN1P07384 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN1P07384 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN1P07384 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN1P07384 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN1P07384 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN1P07384 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN1P07384 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN1P07384 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN1P07384 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN1P07384 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN1P07384 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN1P07384 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN1P07384 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN1P07384 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN1P07384 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN1P07384 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN1P07384 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN1P07384 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN1P07384 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN1P07384 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN1P07384 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN1P07384 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN1P07384 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN1P07384 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAPN1P07384 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN1P07384 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN1P07384 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN1P07384 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN1P07384 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN1P07384 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN1P07384 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN1P07384 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN1P07384 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN1P07384 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN1P07384 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN1P07384 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN1P07384 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN1P07384 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN1P07384 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN1P07384 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN1P07384 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN1P07384 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN1P07384 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN1P07384 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN1P07384 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN1P07384 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN1P07384 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN1P07384 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN1P07384 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN1P07384 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN1P07384 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN1P07384 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN1P07384 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN1P07384 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN1P07384 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN1P07384 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN1P07384 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN1P07384 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN1P07384 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN1P07384 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN1P07384 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN1P07384 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN1P07384 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms