Protein–RNA interactions for Protein: P06730

EIF4E, Eukaryotic translation initiation factor 4E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EP06730 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4EP06730 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4EP06730 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4EP06730 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4EP06730 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4EP06730 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4EP06730 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4EP06730 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4EP06730 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4EP06730 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4EP06730 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4EP06730 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF4EP06730 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF4EP06730 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF4EP06730 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF4EP06730 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4EP06730 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF4EP06730 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4EP06730 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4EP06730 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4EP06730 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4EP06730 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4EP06730 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4EP06730 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4EP06730 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4EP06730 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4EP06730 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4EP06730 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4EP06730 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF4EP06730 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4EP06730 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4EP06730 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4EP06730 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4EP06730 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4EP06730 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4EP06730 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4EP06730 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4EP06730 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4EP06730 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4EP06730 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4EP06730 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4EP06730 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4EP06730 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4EP06730 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4EP06730 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4EP06730 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4EP06730 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4EP06730 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4EP06730 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4EP06730 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4EP06730 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4EP06730 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4EP06730 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4EP06730 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4EP06730 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4EP06730 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4EP06730 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4EP06730 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4EP06730 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4EP06730 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4EP06730 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4EP06730 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4EP06730 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4EP06730 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4EP06730 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4EP06730 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4EP06730 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF4EP06730 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4EP06730 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4EP06730 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4EP06730 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4EP06730 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4EP06730 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF4EP06730 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF4EP06730 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF4EP06730 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4EP06730 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4EP06730 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIF4EP06730 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF4EP06730 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF4EP06730 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4EP06730 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4EP06730 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4EP06730 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4EP06730 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF4EP06730 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF4EP06730 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4EP06730 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4EP06730 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4EP06730 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4EP06730 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4EP06730 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4EP06730 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4EP06730 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4EP06730 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4EP06730 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4EP06730 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4EP06730 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4EP06730 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EIF4EP06730 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms