Protein–RNA interactions for Protein: P06401

PGR, Progesterone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRP06401 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGRP06401 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGRP06401 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PGRP06401 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGRP06401 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGRP06401 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGRP06401 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGRP06401 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGRP06401 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGRP06401 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGRP06401 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGRP06401 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGRP06401 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGRP06401 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGRP06401 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGRP06401 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGRP06401 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGRP06401 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGRP06401 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGRP06401 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGRP06401 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGRP06401 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGRP06401 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGRP06401 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGRP06401 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGRP06401 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGRP06401 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGRP06401 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGRP06401 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGRP06401 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGRP06401 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGRP06401 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGRP06401 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGRP06401 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGRP06401 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGRP06401 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGRP06401 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PGRP06401 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGRP06401 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGRP06401 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGRP06401 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGRP06401 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGRP06401 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGRP06401 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGRP06401 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGRP06401 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGRP06401 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGRP06401 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PGRP06401 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PGRP06401 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PGRP06401 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGRP06401 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGRP06401 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGRP06401 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PGRP06401 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGRP06401 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGRP06401 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PGRP06401 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PGRP06401 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGRP06401 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGRP06401 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGRP06401 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGRP06401 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGRP06401 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGRP06401 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGRP06401 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGRP06401 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGRP06401 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PGRP06401 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PGRP06401 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGRP06401 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGRP06401 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGRP06401 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGRP06401 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGRP06401 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGRP06401 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGRP06401 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGRP06401 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGRP06401 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGRP06401 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGRP06401 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGRP06401 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGRP06401 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGRP06401 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGRP06401 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGRP06401 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGRP06401 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGRP06401 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGRP06401 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGRP06401 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PGRP06401 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGRP06401 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGRP06401 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGRP06401 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGRP06401 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PGRP06401 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGRP06401 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGRP06401 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGRP06401 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGRP06401 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms