Protein–RNA interactions for Protein: P05976

MYL1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL1P05976 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MYL1P05976 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MYL1P05976 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MYL1P05976 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MYL1P05976 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MYL1P05976 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MYL1P05976 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MYL1P05976 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MYL1P05976 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MYL1P05976 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MYL1P05976 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MYL1P05976 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MYL1P05976 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MYL1P05976 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MYL1P05976 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MYL1P05976 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MYL1P05976 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
MYL1P05976 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MYL1P05976 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MYL1P05976 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MYL1P05976 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MYL1P05976 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MYL1P05976 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MYL1P05976 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MYL1P05976 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MYL1P05976 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MYL1P05976 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MYL1P05976 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MYL1P05976 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MYL1P05976 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MYL1P05976 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
MYL1P05976 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MYL1P05976 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MYL1P05976 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MYL1P05976 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MYL1P05976 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MYL1P05976 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MYL1P05976 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MYL1P05976 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MYL1P05976 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MYL1P05976 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MYL1P05976 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MYL1P05976 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MYL1P05976 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MYL1P05976 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MYL1P05976 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MYL1P05976 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MYL1P05976 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MYL1P05976 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MYL1P05976 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MYL1P05976 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MYL1P05976 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MYL1P05976 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MYL1P05976 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MYL1P05976 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MYL1P05976 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
MYL1P05976 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MYL1P05976 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
MYL1P05976 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MYL1P05976 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MYL1P05976 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MYL1P05976 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MYL1P05976 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MYL1P05976 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MYL1P05976 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MYL1P05976 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MYL1P05976 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MYL1P05976 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MYL1P05976 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MYL1P05976 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MYL1P05976 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MYL1P05976 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MYL1P05976 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MYL1P05976 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MYL1P05976 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MYL1P05976 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MYL1P05976 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
MYL1P05976 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MYL1P05976 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MYL1P05976 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
MYL1P05976 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYL1P05976 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYL1P05976 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYL1P05976 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYL1P05976 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYL1P05976 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYL1P05976 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MYL1P05976 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYL1P05976 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYL1P05976 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYL1P05976 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MYL1P05976 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MYL1P05976 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYL1P05976 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MYL1P05976 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MYL1P05976 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYL1P05976 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYL1P05976 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYL1P05976 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYL1P05976 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.1 ms