Protein–RNA interactions for Protein: P05000

IFNW1, Interferon omega-1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNW1P05000 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFNW1P05000 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFNW1P05000 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFNW1P05000 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFNW1P05000 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFNW1P05000 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFNW1P05000 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFNW1P05000 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFNW1P05000 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNW1P05000 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNW1P05000 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNW1P05000 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNW1P05000 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNW1P05000 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNW1P05000 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNW1P05000 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNW1P05000 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNW1P05000 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNW1P05000 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNW1P05000 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNW1P05000 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNW1P05000 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNW1P05000 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNW1P05000 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNW1P05000 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNW1P05000 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNW1P05000 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNW1P05000 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNW1P05000 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNW1P05000 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFNW1P05000 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNW1P05000 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNW1P05000 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNW1P05000 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNW1P05000 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNW1P05000 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNW1P05000 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNW1P05000 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNW1P05000 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNW1P05000 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNW1P05000 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNW1P05000 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNW1P05000 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNW1P05000 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNW1P05000 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNW1P05000 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNW1P05000 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNW1P05000 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNW1P05000 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNW1P05000 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNW1P05000 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNW1P05000 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNW1P05000 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNW1P05000 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNW1P05000 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNW1P05000 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IFNW1P05000 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
IFNW1P05000 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFNW1P05000 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFNW1P05000 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNW1P05000 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNW1P05000 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNW1P05000 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNW1P05000 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNW1P05000 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNW1P05000 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNW1P05000 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNW1P05000 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNW1P05000 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNW1P05000 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNW1P05000 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNW1P05000 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNW1P05000 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNW1P05000 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFNW1P05000 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNW1P05000 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNW1P05000 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNW1P05000 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNW1P05000 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNW1P05000 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNW1P05000 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNW1P05000 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNW1P05000 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNW1P05000 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNW1P05000 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNW1P05000 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNW1P05000 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNW1P05000 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNW1P05000 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNW1P05000 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNW1P05000 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNW1P05000 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNW1P05000 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNW1P05000 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNW1P05000 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNW1P05000 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNW1P05000 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNW1P05000 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNW1P05000 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IFNW1P05000 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms