Protein–RNA interactions for Protein: P04908

HIST1H2AB, Histone H2A type 1-B/E, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H2ABP04908 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HIST1H2ABP04908 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIST1H2ABP04908 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIST1H2ABP04908 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIST1H2ABP04908 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIST1H2ABP04908 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIST1H2ABP04908 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIST1H2ABP04908 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIST1H2ABP04908 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIST1H2ABP04908 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIST1H2ABP04908 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIST1H2ABP04908 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIST1H2ABP04908 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIST1H2ABP04908 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIST1H2ABP04908 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIST1H2ABP04908 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIST1H2ABP04908 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIST1H2ABP04908 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIST1H2ABP04908 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIST1H2ABP04908 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIST1H2ABP04908 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIST1H2ABP04908 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIST1H2ABP04908 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HIST1H2ABP04908 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIST1H2ABP04908 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIST1H2ABP04908 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HIST1H2ABP04908 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIST1H2ABP04908 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIST1H2ABP04908 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIST1H2ABP04908 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIST1H2ABP04908 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIST1H2ABP04908 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HIST1H2ABP04908 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIST1H2ABP04908 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIST1H2ABP04908 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIST1H2ABP04908 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIST1H2ABP04908 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIST1H2ABP04908 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIST1H2ABP04908 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIST1H2ABP04908 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIST1H2ABP04908 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIST1H2ABP04908 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIST1H2ABP04908 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIST1H2ABP04908 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIST1H2ABP04908 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIST1H2ABP04908 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIST1H2ABP04908 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIST1H2ABP04908 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIST1H2ABP04908 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIST1H2ABP04908 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIST1H2ABP04908 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIST1H2ABP04908 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIST1H2ABP04908 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIST1H2ABP04908 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HIST1H2ABP04908 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIST1H2ABP04908 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIST1H2ABP04908 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIST1H2ABP04908 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST1H2ABP04908 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST1H2ABP04908 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST1H2ABP04908 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST1H2ABP04908 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST1H2ABP04908 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIST1H2ABP04908 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIST1H2ABP04908 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIST1H2ABP04908 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIST1H2ABP04908 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HIST1H2ABP04908 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIST1H2ABP04908 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIST1H2ABP04908 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIST1H2ABP04908 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIST1H2ABP04908 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIST1H2ABP04908 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIST1H2ABP04908 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIST1H2ABP04908 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIST1H2ABP04908 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIST1H2ABP04908 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIST1H2ABP04908 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST1H2ABP04908 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST1H2ABP04908 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST1H2ABP04908 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST1H2ABP04908 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST1H2ABP04908 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST1H2ABP04908 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST1H2ABP04908 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIST1H2ABP04908 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIST1H2ABP04908 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIST1H2ABP04908 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIST1H2ABP04908 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIST1H2ABP04908 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIST1H2ABP04908 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIST1H2ABP04908 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIST1H2ABP04908 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIST1H2ABP04908 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIST1H2ABP04908 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIST1H2ABP04908 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIST1H2ABP04908 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIST1H2ABP04908 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HIST1H2ABP04908 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIST1H2ABP04908 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms