Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CYBBP04839 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYBBP04839 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYBBP04839 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYBBP04839 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CYBBP04839 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CYBBP04839 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CYBBP04839 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CYBBP04839 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CYBBP04839 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CYBBP04839 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CYBBP04839 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYBBP04839 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYBBP04839 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYBBP04839 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYBBP04839 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYBBP04839 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYBBP04839 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYBBP04839 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYBBP04839 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYBBP04839 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYBBP04839 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYBBP04839 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYBBP04839 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYBBP04839 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYBBP04839 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYBBP04839 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CYBBP04839 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYBBP04839 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYBBP04839 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYBBP04839 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYBBP04839 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYBBP04839 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CYBBP04839 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYBBP04839 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYBBP04839 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYBBP04839 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYBBP04839 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYBBP04839 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYBBP04839 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYBBP04839 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYBBP04839 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYBBP04839 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYBBP04839 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYBBP04839 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYBBP04839 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYBBP04839 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYBBP04839 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYBBP04839 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CYBBP04839 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CYBBP04839 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYBBP04839 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYBBP04839 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYBBP04839 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYBBP04839 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYBBP04839 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYBBP04839 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYBBP04839 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYBBP04839 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYBBP04839 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYBBP04839 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYBBP04839 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYBBP04839 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYBBP04839 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CYBBP04839 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYBBP04839 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYBBP04839 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYBBP04839 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYBBP04839 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYBBP04839 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CYBBP04839 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYBBP04839 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYBBP04839 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYBBP04839 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYBBP04839 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYBBP04839 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYBBP04839 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYBBP04839 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYBBP04839 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYBBP04839 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CYBBP04839 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYBBP04839 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYBBP04839 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYBBP04839 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYBBP04839 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYBBP04839 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYBBP04839 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYBBP04839 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYBBP04839 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYBBP04839 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYBBP04839 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYBBP04839 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CYBBP04839 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYBBP04839 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYBBP04839 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYBBP04839 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYBBP04839 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYBBP04839 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYBBP04839 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYBBP04839 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms