Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNA21P01568 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNA21P01568 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA21P01568 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA21P01568 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA21P01568 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA21P01568 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA21P01568 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA21P01568 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA21P01568 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA21P01568 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA21P01568 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA21P01568 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA21P01568 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA21P01568 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA21P01568 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA21P01568 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA21P01568 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNA21P01568 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNA21P01568 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNA21P01568 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNA21P01568 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNA21P01568 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNA21P01568 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFNA21P01568 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA21P01568 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA21P01568 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA21P01568 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA21P01568 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNA21P01568 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNA21P01568 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNA21P01568 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA21P01568 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNA21P01568 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNA21P01568 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNA21P01568 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNA21P01568 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNA21P01568 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNA21P01568 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNA21P01568 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNA21P01568 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNA21P01568 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNA21P01568 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNA21P01568 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNA21P01568 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNA21P01568 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNA21P01568 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNA21P01568 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNA21P01568 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNA21P01568 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNA21P01568 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNA21P01568 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNA21P01568 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNA21P01568 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNA21P01568 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNA21P01568 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNA21P01568 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNA21P01568 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNA21P01568 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFNA21P01568 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNA21P01568 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IFNA21P01568 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNA21P01568 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNA21P01568 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNA21P01568 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNA21P01568 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNA21P01568 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNA21P01568 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNA21P01568 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNA21P01568 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNA21P01568 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNA21P01568 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNA21P01568 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNA21P01568 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNA21P01568 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
IFNA21P01568 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFNA21P01568 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNA21P01568 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNA21P01568 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNA21P01568 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNA21P01568 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNA21P01568 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNA21P01568 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNA21P01568 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNA21P01568 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNA21P01568 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFNA21P01568 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFNA21P01568 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFNA21P01568 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNA21P01568 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNA21P01568 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IFNA21P01568 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFNA21P01568 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFNA21P01568 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNA21P01568 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNA21P01568 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNA21P01568 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNA21P01568 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNA21P01568 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNA21P01568 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms